基因与基因组-20150306.ppt

* （1）核酸序列相同：多拷贝基因形成的基因簇， rRNA、tRNA、组蛋白基因家族等。 组蛋白基因家族 （2）核酸序列高度同源 生长激素（GH）与绒毛膜生长催乳激素（CS） 部分序列比对 GH CS ATGGCTCCAGGCTCCCGGACGTCCCTGCTCCTGGCTTTTGCC… ATGGCTACAGGCTCCCGGACGTCCCTGCTCCTGGCTTTTGGC… 7.存在多基因家族与假基因； * （3）编码产物的功能或功能区相同 人类蛋白激酶C家族 （4）假基因（Ψ）：与有功能的基因相似， 不表达或表达产物没有功能。 珠蛋白基因簇中的假基因 ? G? A? ? ? ??2 ??1 Alu 10 kb * 人类线粒体DNA 2个rRNA基因和22个tRNA基因，13个编码蛋白质基因，编码序列占93%。 能自主复制 在细胞内具有多拷贝 主要编码与氧化磷酸化相关的酶系 基因无内含子 基因排列紧密, 无间隔, 有少数重叠。 * DNA基因组: 多数为双链、环状或线性 1.不同病毒基因组可以是不同结构的核酸； 双链线性DNA 单链环状DNA 三、病毒基因组 环状双链DNA 多数为单链、线性 RNA基因组: 单链线性RNA 双链线性RNA * 腺病毒 (adenovirus) 线性双链DNA，编码两大类蛋白质。 E4 E2B E2A E1A E1B E3 L2 L3 L4 L5 L1 3.功能相关基因转录成多顺反子； DNA 2.病毒基因组大部分为编码序列； * 噬菌体ΦX174（phage phix 174 ） 利用有限的核酸贮存更多的遗传信息，提高自身在进化过程中的适应能力。 5386nt 编码2500个氨基酸 5386nt 编码2500个氨基酸 环状单链DNA 4. 基因重叠（gene overlap） * 5.感染真核细胞的病毒，有的基因有内含子； 环状双链DNA 大T抗原和小t抗原的mRNA有不同的剪接方式。 5243 bp Ori 猴病毒 (simian virus 40, SV40 ) 小t 抗原 大T 抗原 * 6.有的病毒基因组连续； 单股正链RNA 核衣壳蛋白(N) 膜蛋白(M) 病 毒 RNA 聚 合 酶 SARS冠状病毒(SARS coronavirus) 刺突蛋白(S) * 埃博拉病毒(Ebola virus) S K Gire et al. Science 2014;345:1369-1372 单股负链RNA(18959nt) Genomic surveillance elucidates Ebola virus origin and transmission during the 2014 outbreak * 7.有的病毒基因组分节段； 禽流感病毒(Avian influenza virus, H7N9) 血凝素（H） 神经氨酸酶（N） 8节段单链RNA 呼肠孤病毒 (reovirus) 外衣壳蛋白 11节段dsRNA 内衣壳蛋白 * 人类免疫缺陷病毒（human immunodeficiency virus, HIV） 单链RNA 逆转录酶 核心蛋白 膜蛋白 （二倍体） 8. 除逆转录病毒(retrovirus)为二倍体外，  其它病毒通常为单倍体基因组。 +ssRNA 翻译 蛋白质 病毒 颗粒 mRNA 转录 ssDNA 反转录 (+ssRNA) dsDNA 整合 dsDNA 乙型肝炎病毒（Hepatitis B virus, HBV） HBcAg 聚合酶 HBsAg 3182bp 3182bp HBsAg 聚合酶 HBcAg HBeAg dsDNA 翻译 蛋白质 mRNA 转录 -ssDNA 反转录 +ssDNA 复制 病毒 颗粒 dsDNA cccDNA 修复 * 开环部分双链DNA 9.不同病毒基因组大小相差较大； 乙型肝炎病毒：~3.2 kb (痘病毒:130-375 kb) * 病毒基因组的结构特点 8. 除逆转录病毒外，为单倍体基因组。 1. 不同病毒基因组可以是不同结构的核酸； 7. 病毒基因组有的是连续的，有的分节段； 6. 有的基因有内含子； 3. 病毒基因组大部分为编码序列； 4. 功能相关基因转录为多顺反子。 5. 有基因重叠现象； 2. 不同病毒基因组大小相差较大； * 谢谢大家！ 吴 坤 陆wukunlu@163.com * 8 * * * * * *