剑麻茎腐病菌基因组SSR标记开发.pdfVIP

热带作物学报2014，35(4)：758—763 Chinese of Journal TropicalCrops 剑麻茎腐病菌基因组SSR标记开发 吴伟怀1，贺春萍”，严传帝2，郑金龙·，李锐1，郑肖兰1，刘巧莲3，易克贤” 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 l农业部热带农林有害生物入侵检测与控制重点开放实验室 海南海口 571101 海南省热带农业有害生物检测监控重点实验室 2海南大学环境与植物保护研究所．海南海口 570228 3中国热带农业科学院热带生物技术研究所．海南海口 571101 摘 要 A’rCC1015菌株全基因组序列．利用GRAMENE网站提供的SSR鉴定工具 下载Asper巧llusn／ger IdentificationT001)，并按含有2～lO个碱基重复、碱基数在18 SSRIT(SimpleSequenceRepeat bp以上的SSR基 ATCC1015全基因组中，共发现4000个2～10碱基SSR，其中含9个 元为标准进行SSR鉴定。结果从A．凡iger 碱基重复基元类型最多。共有1433个．占所鉴定SSR总数的35．8％。其次为6个碱基重复基元类型，共有 择含有SSR的合适区段．从中设计了36对引物．对剑麻茎腐病菌17个菌株的基因组DNA进行了PCR检测． 发现这些引物都能从剑麻茎腐病菌基因组DNA中有效扩增。由此表明．黑曲霉ATCC1015菌株基因组SSR在 剑麻茎腐病菌基因组中具有通用性。这为研究剑麻茎腐病菌群体遗传变异、多样性和进化，定位和克隆功能基 因等提供了分子标记。 关键词黑曲霉：剑麻：SSR标记 中图分类号 Q78：$432．4 文献标识码 A for ofGenomicSSRMarkers Development fromSisal AspergiUusniger WU Weihuail，HE Chuandi2，ZHENGJinlon91 Chunping”，YAN LIRuil，ZHENGXiaolanl，LIU Kexianl+ Qiaolian3，YI 1EnvironmentandPlantProtection TA andControl Institute，CAS／MinistryofAgricultureKeyLaboratoryforMonitoring of and andForestm口∞面eAlienPests／Hainan DetectionControl Laboratoryfor ofTropical TropicalAgricultural Key Pests，Haikou，Hainan571101，China Agricultural 2 EnvironmentandPlant Protecti