人类基因翻译始位置旁侧序列特征的初步分析.pdf

中文摘要 摘 要 1987年，美国学者Kozak通过对699条脊椎动物mRNA 5’非编码区4种碱基 分布概率的统计学研究分析发现，在脊椎动物mRNA翻译起始位点上游一段序列相 Rule)”。该保守序列特征在新基因预测和生物工程产品的开发与研究中起到了重 要的指导作用。16年来，生命科学得到了飞速的发展，人类已知基因的数目在急 剧增加，在各类基因库中亦收录了不计其数的不同物种或不同种属的基因序列。 然而，通过对大样本数据的统计来分析、验证“Kozak规则”目前尚未见报道。 智人(肋∞＆妒j朗曲mRNA序列，一方面对翻译起始位点旁侧序列中碱基分布特性 进行概率学分析，以期在大样本量的情况下重新分析mRNA翻译起始位点旁例碱基 的特征；另一方面，分析翻译终止密码子串联情况，以期找出密码子串联使用的 整体规律。 密码子、终止密码子上、下游一定数目碱基进行分析，得出以下主要结论： 2、终止密码子为TGA的序列最多，几乎是统计总数的一半；不同终止密码子， 其旁侧序列分布规律不完全一致。 3、同相位终止密码子串联现象中，终止密码子的个数分别从2到4，其中 94．83％为两个终止密码子串联使用。在两个串联终止密码子现象中，数量最多的 在同相位起始密码子串联现象，309条序列存在异相位起始密码子串联现象，大多 数也为两个串联使用。此外有35条序列在CDS字段标注的翻译起始位点前存在 待进一步考证和研究。 分析认为，同相位终止密码子串联的序列所翻译的蛋白质可能在生命活动中 中文摘要 起较关键的调控作用，第一个终止密码子出现误读或由于碱基突变而没有终止翻 译后，后续串联的终止密码子可再次起到终止翻译作用。关于异相位终止密码串 联，可能是在mRNA的编码区中有碱基插入或缺失时，正确终止蛋白质的翻译。 本文主要做了部分数据分析工作，进一步的功能分析和生物学验证需要补充 完善。同其它模式生物有关规律的比较也是下一步要研究的重要内容。 ．2一 Abstract In1 have been frOm 987，5’一nOncOdlng 699 sequences cOmpiled vertebrale mRN，b and by analyzed aslhe cOnsensus fOrinitiatiOnOf sequence transIationinvertebrates．This consen／ed theATGinitiatOr codOn sequence hasbeen flanking role”．It designated“KOzak an rOleinthe OfnOveI and plays research impOrtant