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原核生物DNA与蛋白质相互作用机制与方式 刘琼 生物学13班 学号：107551300735 2013年10月10日 原核生物DNA与蛋白质的相互作用机制 λ阻遏物-操纵基因相互作用 1.一般结构特征 首先，每个阻遏物单体的识别螺旋以两个半位点 嵌入在DNA大沟里。还可以看到螺旋5和5’相互 靠近将阻遏物二聚体拉在一起。DNA的形状与 标准B型DNA类似，且DNA有稍许弯曲，尤其 在其两端曲向阻遏物二聚体，但螺旋的其余部 分是相对直的。 原核生物DNA与蛋白质的相互作用机制 2.与碱基的相互作用 出现在DNA大沟的氨基酸与DNA 碱基和DNA骨架形成氢键是DNA 与蛋白质相互作用的重要方式。 通过两个氨基酸与两个或更多 DNA位点结合所形成的的氢键网 可以稳定一些氢键。且氨基酸间 也有氢键，这种氢键网络使复合 体结构更加稳定。 原核生物DNA与蛋白质的相互作用机制 3.氨基酸/DNA骨架的相互作用 氨基酸侧链与DNA骨架磷酸基团间 相互作用有助于蛋白质-DNA的吸附。 众多氨基酸/DNA磷酸简单结合表明， 这些相互作用对稳定蛋白质-DN A复合 体起重要作用。 原核生物DNA与蛋白质的相互作用机制 以λ阻遏物-操纵基因相互作用为例表明原核生物DNA与蛋白质的相互作用机制是通过氨基酸与DNA，氨基酸之间，以及氨基酸侧链与DNA磷酸基团间的氢键间的相互作用来稳定DNA与蛋白质的相互作用的。 原核生物DNA与蛋白质的相互作用方式 1.螺旋-转角-螺旋 λ阻遏物识别螺旋位于相应操纵基因 DNA的大沟内，这种结合的特异性依 赖于识别螺旋的某些氨基酸与伸入 DNA大沟的某些碱基的功能基团的特 异性结合，以及与DNA骨架上的磷酸 基团的特异性结合。 原核生物DNA与蛋白质的相互作用方式 2.远程作用 当两个λ操纵基因被整数螺旋 隔开时，其间的DNA成环外凸 ，允许协同结合。当操纵基因 被非整数螺旋隔开时，蛋白质 只能结合到DNA双螺旋的对面， 所以不能发生协同作用。 原核生物DNA与蛋白质的相互作用方式 原核生物DNA与蛋白质的相互作用方式有螺旋-环-螺旋方式和远程作用方式。4个不同碱基对呈现4种不同氢键模式，与指向DNA大小沟的氨基酸结合。而多聚DNA结合蛋白对DNA结合位点的亲和性高于独立结合的多聚单体蛋白，其优势是可以协同性地与DNA结合。 谢谢！ * * *