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与DNA结合蛋白相作用的启动子序列的鉴定
中国试剂网 3.9.256
与DNA 结合蛋白相作用的启动子序列的鉴定
番茄子叶细胞核的分离提取为例子进行实验
步骤2~7 须在4 ℃下使用高压灭菌过的设备进行。
1.将番茄种子种在灭菌的水饱和滤纸上,置于小盆内,用薄膜封口后,培养 7
天。用刀片切下番茄子叶后收集备用。
2 .将40~50g 新鲜组织放入300ml 匀浆缓冲液,用韦林氏搅切器先1×4 秒而后
6 ×1 秒。
3 .过滤匀浆混合液,使其透过漏斗上的4 层厚纱布及纱布下按孔径递减次序放
置的3 层Nitex 尼龙筛网 (300 μm ,100 μm ,52 μm ),汇入大烧杯中。全部匀
浆物均滤完后把纱布集中在一起,将纱布上的滤液压入尼龙网,并使其经漏斗流
入烧杯中。切勿将滤液压出尼龙网,亦不可使用抽滤,让滤液靠重力作用下流。
4 .将每批滤出的匀浆倒入 500ml 离心瓶中,用 Sorvall GS-3 转头 5000r/min
(4225g ),4 ℃离心20 分钟。
5 .吸去上清,然后将核粗提沉淀物用大口径塑料巴斯德吸管温和地反复吹吸,
使沉淀悬浮于匀浆缓冲液中。将重悬起的沉淀转入50ml 离心管中,用匀浆缓冲
液调节体积至约40ml 。
6 .4 ℃用Sorvall SS-34 转头4000r/min (1912g)离心10 分钟,再次沉淀细胞
核。重复步骤5 和6 三次,分别在3500r/min 离心10 分钟,8 分钟和6 分钟。最
后一次离心后,尽可能洗净匀浆缓冲液。
7 .将核悬浮于核悬浮缓冲液中,按每50g 植物组织加0.5ml 核悬浮缓冲液。用
液氮冷冻,保存于-80℃。若核蛋白抽提即将进行,可不必将核冷冻起来。
核抽提物的制备
1.将细胞核置于冰上解冻,精确测定核悬浮液的体积。
2 .加入核裂解缓冲液,使NaCl 终浓度为0.47 mol/ (即,每毫升核悬浮加入182
μl 核裂解液)。
3 .将核悬浮液置于摇床上,4 ℃温和摇动30 分钟。
4 .4 ℃微量离心20 分钟沉淀染色质。
5 .小心移出上清,避免搅起胶状的含 DNA 的沉淀,以使抽提液中避免含有此
类杂质。
中国试剂网 3.9.256
6 .4 ℃透析上清3~4 小时,中间换几次透析液。
7 .将透析液用液氮冷冻,再置于冰上解冻,4 ℃微量离心或用Sorvall SS-34 转
头10 000r/min (12 000g)离心15 分钟,弃沉淀,保留上清。此步骤是为了将其
余可能在浓缩步骤中阻塞微量浓缩器的蛋白质沉淀除去。
8.用 CENTRICONTM10 微量浓缩器浓缩上清,以使提取液中蛋白质的终浓度
为 1~3mg/ml 。可以溶菌酶为标准物用Bio-Rad Bradford-based 蛋白质分析试剂
盒来测定蛋白质浓度。经验表明,要达到上述浓度,至少需要浓缩2~3 次。
9 .留出待作迁移分析的核抽提物,将剩余部分用液氮或干冰冷冻,贮于-80℃
备用。
DNA 片段的标记
聚丙烯酰胺凝胶的制备
1.安装凝胶装置并洗净玻璃板。
2 .配制4 %丙稀酰胺凝胶液,将以下成分混合:
丙稀酰胺/双丙稀酰胺 (29 :1) 4ml
TBE (10×) 3ml
APS (10%)
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