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基因分析与蛋白质预测.ppt
基因分析与蛋白质结构预测 某天，Prof. Gene发现人的Hela细胞中，有丝分裂期间有异常情况：细胞不再分裂，而是开始凋亡(表型，phenotype)，通过实验的方法(例如，酵母双杂交)，发现了与有丝分裂期间某个蛋白可能相互作用的一个基因，测序结果如下(genotype)： CCCCTGCCTGGCAGCCCTTTCTCAAGGACCACCGCATCTCTACATTCAAGAACTGGCCCTTCTTGGAGGGCTGCGCCTGCACCCCGGAGCGGATGGCCGAGGCTGGCTTCATCCACTGCCCCACTGAGAACGAGCCAGACTTGGCCCAGTGTTTCTTCTGCTTCAAGGAGCTGGAAGGCTGGGAGCCAGATGACGACCCCATAGAGGAACATAAAAAGCATTCGTCCGGTTGCGCTTTCCTTTCTGTCAAGAAGCAGTTTGAAGAATTAACCCTTGGTGAATTTTTGAAACTGGACAGAGAAAGAGCCAAGAACAAAATTGCAAAGGAAACCAACAATAAGAAGAAAGAATTTGAGGAAACTGCGGAGAAAGTGCGCCGTGCCATCGAGCAGCTGGCTGCCATGGATTGAGGCCTCTGGC 实例分析 1. 这是哪个基因？ 2. 编码的蛋白质序列是怎样的？ 3. 有没有保守的功能结构域 (domain)？ 4. 它的功能是怎样的？ 5. 有没有三级结构信息？ 主要问题 基因序列数据的查询 /Blast.cgi 1.该基因为人的Survivin(BIRC5) 抗凋亡基因 ; 2.染色体定位：17号染色体，； 3.基因标识符：NM_001168.2; 4.功能分析：细胞周期酶结合，半胱氨酸型内肽酶的抑制因子等。 结论1 蛋白质功能及结构分析 蛋白质功能域分析 3D structure view 1. 在肿瘤形成过程中可能起一定作用； 2. 阻碍G2/M期的细胞编程性凋亡； 3. Chromosomal passenger complex (CPC) 的成员之一； 4.细胞亚定位：胞质，核。 结论2
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