人类丁酰胆碱酯酶(BuChE)与抑制剂小分子的对接研究.pdfVIP

第4卷 第9期 2009 年 9 月 中国科技论文在线 Sciencepaper Online 1 人类丁酰胆碱酯酶(BuChE)与抑制剂小分子 的对接研究 孟烜 宇，楚慧郢，郑清川 （吉林大学理论化学研究所理论化学计算国家重点实验室，长春 130023 ） 摘 要：利用分子力学和分子动力学模拟方法优化人类丁酰胆碱酯酶(BuChE) 的晶体结构(PDB Code ：1XLU)，在 基础上用分子对接程序(Affinity)将其抑制剂利伐斯的明(rivastigmine)和抑制剂TV-3326 分别与BuChE进行对接，获得了 其复合物结构的理论模型。 通过配体与受体之间相互作用能和结构的分析给出了与抑制剂的具体结合方式，明确了 BuChE与抑制剂结合时起重要作用的氨基酸残基，为基于人类丁酰胆碱酯酶三维结构药物设计提供重要的参考信息。 关键词：药物结构；人类丁酰胆碱酯酶；分子对接；利伐斯的明；TV-3326 中图分类号：O6 文献标识码：A 文章编号：1673－7180(2009)09 －0000 －0 Docking Studies on Human Butyrylcholinesterase with Inhibitors Meng Xuanyu ，Chu Huiying ，Zhang Qingchuan (State Key Laboratory of Theoretical and Computational Chemistry, Institute of Theoretical Chemistry, Jilin University, Changchun 130023, China) Abstract: The model of human butyrylcholinesterase (BuChE) was optimized by using Molecular mechanics and Molecular dynamics(PDB Code ：1XLU). Based on this model, the complex structures of the inhibitors with BuChE were obtained and investigated through ligand-receptor docking studies by means of Affinity. The binding pattern predicted by the affinity module reveals some important residues interacted with inhibitors, and provides a further refinement of the BuChE inhibitor binding interaction as a basis for new structure-based design efforts. Key words: BuChE ；docking ；rivastigmine ；TV-3326 上较为接受的 AD 病理为“胆碱能缺失学说”, 该学 0 引 言 说认为老年性痴呆症患者大脑内神经递质乙酰胆碱 阿尔茨海默病(Alzheimers disease ，AD)是一种 (Ach)的缺失是导致 AD 疾病的关键原因。通过抑制 中枢神经系统渐进发展的致死性神经原发性退行病 人体内代谢ACh 的乙酰胆碱酯酶(AChE)可以提高脑 变，是老年痴呆症中最常见的一种类型[1-2] 。AD 发 内ACh 的水平，从而达到控制 AD 病情的目的[3] 。 病机制复杂, 其致病因素至今