成都平原主养草鱼·搭配鲫鱼池塘底泥中的细菌群落结构分析.pdfVIP

成都平原主养草鱼·搭配鲫鱼池塘底泥中的细菌群落结构分析.pdf

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安徽农业科学 ,JournalofAnhuiAgn.Sei.2014,42(17):5477—5480 责任编辑 陈玉敏 责任校对 李岩 成都平原主养草鱼 ·搭配鲫鱼池塘底泥中的细菌群落结构分析 唐凌 ,邝声耀 ,刘兴国,张纯 ,张锦秀 (1.四川省畜牧科学研究院,四川成都610066;2.中国水产科学研究院渔业机械仪器研究所,上海200092) 摘要 [目的]分析成都平原主养草鱼、搭配鲫鱼池塘底泥中的细菌群落结构。[方法]通过构建细菌16SrRNA基因克隆文库,对阳性 克隆子进行多样性分析和构建系统发育树。[结果]依据97%序列相似性划分OUT,所构建的文库共获得 171个克隆子.并划分为 14 个OTUs(操作分类单元),其多样性指数Shannon(日)和优势度指数 Simpson(D)分别为2.12和7.15,丰富度指数s 和5 均为 16。 池塘底泥中主要的细菌类群为:梭杆茵门(24%)、变形菌门(55%)、浮霉茵门(10.5%)、绿弯茵门(5.9%)、拟杆菌门(2.3%)、放线茵门 (1.8%)和厚壁菌门(0.6%)o 【结论 lCetobacterium 、Prolixibacter、Rhodocyclus、Candidate、Planctomycetacia、Thiocapsa、Desulfomicrobium和 Sterolibacterium等属茵在脱氮除磷、降低硫化物、降解有机质等发挥重要作用。池塘底泥既是水生态系统修复功能茵的资源库,但也存 在着Xanthomonas等致病性和功能未知的细菌库。 关键词 草鱼、鲫鱼;池塘底泥;16SrRNA;细菌多样性 中图分类号 $965.1 文献标识码 A 文章编号 0517—6611(2014)17—05477—04 InvestigationofBacterialCommunityStructureinChengduFish—farm SedimentStockedwithDominatedGrassCarpandSubordinate Crucina TANGLingetal (SichuanAcademyofAnimalScience,Chengdu,Sichuan610066) Abstract [Objective] epaperwastoinvestigatebacterialcommunitystructureinChengdufish—farmsedimentstockedwithdominatedGrass CarpandsubordinateCrucian.[Method]Throughtheconstructionof16SrRNAcloninglibraryofbacteria,thepositiveclonewascarriedout communitydiversityanalysis,andthephylogenetictreewasconstructed.[Result]OUT(OperationalTaxonomicUnits)wasclassifiedaccording tosequencessimilarityof97% ,all171cloneswereclusteredinto13OTUs.Th erichnessindexSh1andSAcEwere16and16,andthedominan— cyindex(D)anddiversityindex(H)were2.12and7.15,respectively.AllsequenceswererespectivelyfellintothephylumofFusobacteria (24%),Proteobacteria(55%),Planctomycetes(10.5%),Chloroflexi(5.9%),Bacteroidetes(2.3%),Actinobacteria(1.8%)andFirmi— cutes(0.6%).[Conclusion],r}lemembersofCetobacterium,Prolixibacter,Rhodocyclus,Candidate,Planctomycetacia,Thiocapsa,Desulfomi— crobium andSterolibacterium playakeyrole in denitrogenation,phosphoursnad sulfatereducingandorganicsdegradation,whiletheXan— th

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