基因表达系列的分析技术在植物基因表达的分析中应用.pdfVIP

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中国农业科学 2003,3600:1233一1240 ultum Agrmc 基因表达系列分析技术在植物基因表达分析中的应用 朱 莉1,2,常汝镇 ,‘邱丽娟’,2 (’中国农业科学院作物品种资源研究所/农业部作物种质资源与生物技术重点开放实脸室,北京 looo81;2新毅农业大学,乌鲁木齐 830052 摘要:蕃因表达系列分析技术(SAGE)是一种以测序为墓础,采用数字化分析手段,在转录物水平上研究细胞 或组织墓因表达模式的有效工具。该技术不仅能够全面地分析特定组织或细胞表达的荃因,获得这些蕃因表达丰 度的数I信息,还可比较不同组织、不同时空条件下墓N表达的差异,从而发现新基因。SAGE技术在植物方面的 应用相对较少,但进展很快。本文着重介绍了SAGE在植物基因表达分析中的应用,分析SAGE所存在的问题、改 进方法及发展前景。 关健词:SAGE;全墓因组表达须谱;差异表达;转录组;功能签因组 A Application。,SerialAnalysis,Gen忿pressionintheAnalysisof GeneExpressioninPlant ZHULil2,CHANGRu-zhenl,QIULi-juan.2 (tKeyLaboratoryofCropGemrplasmBiotechnology,MinistryofAgriculture/lwtit}ofCropGempimmResaurcas, ChineseAcademyofAgriculturalSciences,Beijing100081;2XigiwrgAgiculturalUrdmrsal,Ururngi830052) Abstract;Serialanalysisofgeneexpression(SAGE)isapowerfulsequence-basedtool,whichallowstheanalysisof geneexpressionpatternsincellortissueattheleveloftranscriptswithdigitalanalysis.Itcanbeusednotonlytooveral- lyanalyzethegenesthatexpressedinspecificcellsortissues,inordertogetthequantityinformationoftheexpressed genes,butalsotosimultaneouslycomparethedifferentialgenesexpressedindifferenttissuesandconditionsforgenemin- ing.TheapplicationofSAGEisfai海 littleinplant,butincreasesrapidly.InthefutureSAGEwillbemoreandmore usedinplantfunctionalgenomies.Inthisreview,theapplicationandimprovementofSAGEinplantgenomicresearch are beenintroduced. Keywords:SAGE;Whole-genomeexpressionprofile;Differentialexpression;Transcriptome;Functionalgenomc 功能基因组学(functionalgenomics)是生命科学 的GeneCalling技术[,〕。 研究的一大重点川,而基因表达分析则是基因功能 差异显示或定量RT-PCR技术可以确定转录物 研究最重要的组成部分。 之间的不同,但不能提供全面的表达分布图。基因 基因表达水平的发现对研究及了解生物体特性 芯片技术虽然能同时分析许多转录物,但受杂交变 和基因

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