癌症诊断芯片的癌睾丸基因的寡核苷酸探针的的设计.pdfVIP

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2017-09-04 发布于安徽
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2009；4。(2)：330一333一’‘’。……。…。 i 四J S川ich大uan学U学niv报(M‘ed医Sc掌E版di)’ 癌症诊断芯片的癌一睾丸基因的寡核苷酸探针的设计* 刘丽1，丁洪2，刘丹1，陆群1，SophieRousseaux3，吴芳1△ I．西南交通大学生物工程学院(成都610031)I2．四川大学华西药学院‘ 3．FrenchNationalInstitudeforHealthandMedlealResearch(INSERM)．U823。GrenobleF-38706．France 【摘要】目的列的探针系列。以阐明CT基因在肿瘤发生过程中的作用并检测它们在肿瘤细胞或肿瘤样本中的表达。方法通 Calculator寡核苷酸性质计算软件”和。OligoAnalyzer3．0”检测探针的解链温度(Tin)、。OligonucleotideProperties mers左右的寡 GC含量和可能形成的次级结构等特性。结果为CT基因家族的44个成员成功设计了113个50 核苷酸探针。其Tm值分布在63．2℃～67．5℃之间．GC百分含量为35．3％～51．5％。结论结合IDT和 MEDIANTE两个探针设计软件．能有效的进行CT基因寡核苷酸探针的设计。【关键词】癌一睾丸基因寡核苷酸探针探针设计微阵列【中图分类号】Q78 of ProbesforCancer-testisGenesfor LI己，Lil．DING Design Cancer I-lon92， Oligonuleotide DiagnosisMicroarray LJL，Danl，LUQunl．ROUSSEAUX Sophie3。WUFan91△．1．CollegeofBioengineering，SouthwestJiaotong 610031．China；2．WeStChinaSchool 610041， University．Chengdu of NationallnstitudeHealthandMedical F-38706． China；3．French for Franee To for fora [Abstract]ObjectlvedesignoligonucleotideprobesCancer-testis(CT)genesmicroarray，which willbededicatedtOa of intumorsandelucidationof ofCT transcriptomicanalysistestis-specificgenes therole genes inthe of The forCT were a processtumorigenesis．Methodsoligonucleotideprobes genes designedthrough combinationoftWO toolsavailableonline．IDT probedesigning and Properties