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2017-09-13 发布于重庆
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基于禁忌遗传算法RNA二级结构预测.pdf

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第40 卷第5 期电子科技大学学报 Vol.40 No.5 20 11年9月 Journal of University of Electronic Science and Technology of China Sep. 20 11 基于禁忌遗传算法的RNA二级结构预测 1,2 3 1 刘勇国，朱婵，晏华 (1. 电子科技大学计算机科学与工程学院成都 611731; 2. 苏州大学江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州 215006; 3. 四川建筑职业技术学院图书馆四川德阳 618000) 【摘要】生物RNA 二级结构预测是生物信息学领域的一个重要研究问题。近来，研究人员提出应用元启发式算法来预测 RNA 二级结构。该文提出基于禁忌遗传算法的RNA 二级结构预测方法(TGARNA) ，给出茎区相容性检测改进方法，保留最长茎区构造茎区相容个体，以改善种群性能；同时将禁忌有哪些信誉好的足球投注网站融入遗传操作以防止近亲繁殖，保持种群多样性。仿真实验表明 TGARNA算法能够有效预测RNA 二级结构。关键词遗传算法; 最小自由能; RNA 二级结构预测; 禁忌有哪些信誉好的足球投注网站 + 中图分类号 TP202 .1 文献标识码 A doi:10.3969/j.issn.1001-0548.2011.05.025 RNA Secondary Structure Prediction Based on Tabu Genetic Algorithm 1,2 3 1 LIU Yong-guo , ZHU Chan , and YAN Hua (1. School of Computer Science and Engineering, University of Electronic Science and Technology of China Chengdu 611731; 2. Provincial Key Laboratory for Computer Information Processing Technology, Soochow University Suzhou Jiangsu 411105; 3. Library, Sichuan College of Architectural Technology Deyang Sichuan 618000) Abstract RNA secondary structure prediction is an important problem in the research field of bioinformatics. Recently, researchers applied metaheuristics to predict RNA secondary structure. In this article, a new predicting method called tabu genetic algorithm based RNA secondary structure prediction (TGARNA) is developed. In the TGARNA algorithm, an improved me