（2025版）实体瘤基因测序共检专家共识解读PPT课件.pptxVIP

(2025版)实体瘤常见驱动基因DNA和RNA高通量测序共检专家共识精准检测，规范诊疗新标准

目录第一章第二章第三章背景与必要性共识核心内容技术方法

目录第四章第五章第六章临床应用实施挑战与对策总结与展望

背景与必要性1.

实体瘤驱动基因概述驱动基因定义：驱动基因是指能够直接促进肿瘤发生、发展的关键基因变异，包括点突变（如EGFRL858R）、插入缺失（如EGFRexon19del）、基因融合（如ALK-EML4）和拷贝数变异（如HER2扩增），这些变异可作为治疗靶点或预后标志物。实体瘤常见驱动基因：非小细胞肺癌中的EGFR/KRAS/BRAF突变、ALK/ROS1/NTRK融合；结直肠癌中的KRAS/NRAS/BRAF突变；胆管癌中的FGFR2融合和IDH1突变等，不同瘤种驱动基因谱存在显著异质性。检测必要性：约70%的实体瘤患者携带可干预的驱动基因变异，全面检测可指导靶向治疗（如奥希替尼用于EGFRT790M）、免疫治疗（如PD-1抑制剂用于高TMB患者）及临床试验筛选，显著提升临床获益率。

技术互补性：DNA-NGS擅长检测单核苷酸变异（SNV）和小片段插入缺失（Indel），但对跨内含子的基因融合检出率低（如ROS1融合漏检率可达15%）；RNA-NGS通过直接捕获融合转录本，将融合检出灵敏度提升至95%以上。临床漏检风险：基于ARMS-PCR或DNA-NGS的单一检测可能导致10%-15%的可靶向融合漏检（研究显示NSCLC中RNA-NGS可额外检出10%的ALK/ROS1/NTRK融合患者），共检可降低假阴性率。样本节约优势：同步共检方案（如银丰基因产品）通过单次建库同时分析DNA/RNA，相比序贯检测节省50%样本量（尤其适用于穿刺小样本），且缩短报告周期至7-10个工作日。经济性评估：平行检测虽成本较高（约增加30%费用），但可避免因漏检导致的无效治疗（如ALK融合患者误用EGFR-TKI），从整体医疗支出角度更具成本效益。DNA与RNA共检技术价值

2025版共识制定背景随着泛癌种靶向药物获批（如拉罗替尼用于NTRK融合实体瘤），2024年我国NGS检测量同比增长120%，但实验室间操作规范差异导致结果可比性不足（如RNA质控标准不统一）。临床需求激增国内75%的实验室仍采用DNA单检，且RNA检测中FFPE样本降解阈值（DV200）、探针覆盖度（如NTRK1/2/3外显子覆盖要求）等关键参数缺乏行业标准。技术标准缺失中华医学会病理学分会联合国家病理质控中心，基于3,787例实体瘤多中心研究数据（包括非小细胞肺癌、胆管癌等高融合瘤种），经德尔菲法两轮专家论证形成23条核心推荐意见。多学科协作成果

共识核心内容2.

技术互补性：DNA-NGS擅长检测单核苷酸变异（SNV）和插入缺失（Indel），而RNA-NGS可显著提升融合基因（如ALK、ROS1、NTRK）的检出率，尤其适用于非小细胞肺癌、胆管癌等融合高发的实体瘤类型。检测策略灵活性：根据临床需求可选择序贯检测（经济但耗时）、平行检测（全面但成本高）或同步共检（快速且节省样本），以适应不同样本量和时效性要求。质控标准化：明确FFPE样本的保存时效（≤2年），强调RNA完整性评估（如DV200指标），并采用生信分析的双维度质控（DNA与RNA数据独立分析）以确保结果可靠性。报告规范化：要求检测报告涵盖变异类型、临床意义分级（如TierI/II）、药物敏感性及耐药性注释，并附实验室质控参数，便于临床解读。专家共识关键要点

适用瘤种优先推荐用于非小细胞肺癌、甲状腺癌、胆管癌等已知驱动基因变异（突变/融合）高发的实体瘤，尤其是初治或耐药后需全面评估的患者。样本要求明确FFPE样本肿瘤细胞占比≥20%，核酸总量需满足DNA≥50ng、RNA≥100ng，且RNA完整性DV200≥30%以保障检测成功率。临床场景适用于靶向治疗前筛查、耐药机制探索、罕见变异检测及临床试验入组筛选，但不推荐用于早期筛查或低肿瘤负荷患者。共检适用范围与标准

新增基因列表扩展了融合基因检测范围，新增METexon14跳跃突变、NRG1融合等新兴靶点，覆盖更多潜在治疗靶标。引入AI驱动的融合基因预测模型（如Arriba+STAR-Fusion联合分析），降低假阳性率并提升低频变异检出灵敏度。调整RNA降解阈值（DV200从≥50%放宽至≥30%），适配临床实际样本条件，同时新增DNA文库复杂度（≥80%）的质控指标。首次提出多中心数据互认标准，要求实验室采用参考样本（如Horizon标准品）验证不同测序平台（Illumina/MGI）的一致性。生信算法升级质控阈值优化跨平台验证2025版更新亮点

技术方法3.

01采用FFPE组织或新鲜冷冻样本，通过DNA提取试剂盒获取高质量DNA