2025年单细胞ATAC-seq峰值Calling与染色质可及性分析考核试卷.docVIP

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2025年单细胞ATAC-seq峰值Calling与染色质可及性分析考核试卷

一、单项选择题(每题1分,共30题)

1.在单细胞ATAC-seq数据分析中,峰值Calling的主要目的是什么?

A.定量基因表达水平

B.识别基因组中的可及区域

C.测量染色质构象

D.确定DNA序列变异

2.峰值Calling过程中,常用的算法不包括以下哪一项?

A.MACS2

B.peakcaller

C.SCATAC

D.DESeq2

3.单细胞ATAC-seq数据中,峰值的定义通常基于什么?

A.读数数量

B.读数比例

C.读数分布

D.读数密度

4.以下哪个指标可以用来评估峰值Calling的准确性?

A.RPKM

B.FPKM

C.Q-value

D.Peakheight

5.在单细胞ATAC-seq数据分析中,可及区域的识别通常基于什么?

A.峰值数量

B.峰值长度

C.峰值高度

D.峰值位置

6.以下哪个工具常用于单细胞ATAC-seq数据的峰值Calling?

A.Seurat

B.Scanpy

C.CellRanger

D.Alloftheabove

7.单细胞ATAC-seq数据中,峰值的调用阈值通常如何确定?

A.基于统计显著性

B.基于实验设计

C.基于文献报道

D.以上都是

8.以下哪个指标可以用来评估染色质可及性的变化?

A.峰值数量

B.峰值长度

C.峰值高度

D.峰值位置

9.在单细胞ATAC-seq数据分析中,如何识别可变可及区域?

A.基于峰值数量的变化

B.基于峰值高度的变化

C.基于峰值长度的变化

D.以上都是

10.以下哪个工具常用于单细胞ATAC-seq数据的染色质可及性分析?

A.Seurat

B.Scanpy

C.CellRanger

D.Alloftheabove

11.单细胞ATAC-seq数据中,如何评估染色质可及性的差异?

A.基于峰值数量的差异

B.基于峰值高度的差异

C.基于峰值长度的差异

D.以上都是

12.在单细胞ATAC-seq数据分析中,如何识别活性染色质区域?

A.基于峰值的富集

B.基于峰值的稀疏

C.基于峰值的长度

D.以上都是

13.以下哪个指标可以用来评估活性染色质区域的变化?

A.峰值数量

B.峰值高度

C.峰值长度

D.峰值位置

14.在单细胞ATAC-seq数据分析中,如何识别沉默染色质区域?

A.基于峰值的富集

B.基于峰值的稀疏

C.基于峰值的长度

D.以上都是

15.以下哪个工具常用于单细胞ATAC-seq数据的沉默染色质区域识别?

A.Seurat

B.Scanpy

C.CellRanger

D.Alloftheabove

16.单细胞ATAC-seq数据中,如何评估沉默染色质区域的变化?

A.基于峰值数量的变化

B.基于峰值高度的变化

C.基于峰值长度的变化

D.以上都是

17.在单细胞ATAC-seq数据分析中,如何识别染色质边界?

A.基于峰值的富集

B.基于峰值的稀疏

C.基于峰值的长度

D.以上都是

18.以下哪个工具常用于单细胞ATAC-seq数据的染色质边界识别?

A.Seurat

B.Scanpy

C.CellRanger

D.Alloftheabove

19.单细胞ATAC-seq数据中,如何评估染色质边界的变化?

A.基于峰值数量的变化

B.基于峰值高度的变化

C.基于峰值长度的变化

D.以上都是

20.在单细胞ATAC-seq数据分析中,如何识别染色质环化?

A.基于峰值的富集

B.基于峰值的稀疏

C.基于峰值的长度

D.以上都是

21.以下哪个工具常用于单细胞ATAC-seq数据的染色质环化识别?

A.Seurat

B.Scanpy

C.CellRanger

D.Alloftheabove

22.单细胞ATAC-seq数据中,如何评估染色质环化的变化?

A.基于峰值数量的变化

B.基于峰值高度的变化

C.基于峰值长度的变化

D.以上都是

23.在单细胞ATAC-seq数据分析中,如何识别染色质开放区域?

A.基于峰值的富集

B.基于峰值的稀疏

C.基于峰值的长度

D.以上都是

24.以下哪个工具常用于单细胞ATAC-seq数据的染色质开放区域识别?

A.Seurat

B.Scanpy

C.CellRanger

D.Alloftheabove

25.单细胞ATAC-seq数据中,如何评估染色质开放区域的变化?

A.基于峰值数量的变化

B.基于峰值高度的变化

C.基于峰值长度的变化

D.以上都是

26.在单细胞ATAC-seq数据分析中,如何识别染色质关闭区域?

A.基于峰值的富集

B.基于峰值的稀疏

C.基于峰值的长度

D.以上都是

27.以下哪个工具常用于单细胞ATAC-seq数据的染色质关闭区域识别?

A.Seurat

B.Sc

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