基因工程第一章核酸的制备优品文档.pptVIP

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基因工程第一章核酸的制备;核酸:遗传信息的储存物质;第一节天然DNA的制备(PreparationofDNA);主要碱基的化学结构:;结构:;DNA;DNA;解链温度(Tm,meltingpoint);DNA分子杂交(HybridizationofDNAstrandsfromdifferentsources);0,EDTA1mmol/L)

要求:浓度过高易产生错误碱基的掺入,浓度过低则降低反应产量

与细菌核蛋白体的30S亚单位结合,干扰核糖体上密码子与反密码子的相互作用,从而阻止氨酰基tRNA同核蛋白体结合,5mg/mL(乙醇溶液);

标准的PCR反应条件:

反向PCR锚定PCR

方法:以反转录的cDNA作模板所进行的PCR反应,

(5)7210

一次性加好反应液,2~4小时完成扩增

实时定量PCR多重PCR

开环DNA(opencircleDNA,oc-DNA);

方法:对某个已知DNA片段两侧的未知序列进行扩增。

超螺旋DNA(supercoiledDNA,SC-DNA);;二、天然DNA的提取(PurificationofDNA);2.大肠杆菌(E.coli)常见抗生素(Antibiotics)的使用:

2.1氨苄青霉素(ampicillin,Ap):

抑制细菌细胞壁肽聚糖的合成,50~150μg/mL(水溶液);

2.2链霉素(streptomycin,Sm):

与细菌核糖体30S亚单位结合,抑制细菌蛋白质(酶)的合成,使细菌不能正常生长或者代谢而死亡,25~50μg/mL(水溶液);

2.3四环素(tetracycline,Tc):

与细菌核蛋白体的30S亚单位结合,干扰核糖体上密码子与反密码子的相互作用,从而阻止氨酰基tRNA同核蛋白体结合,5mg/mL(乙醇溶液);

2.4氯霉素(chloramphenicol,Cm):

与细菌核蛋白体50S亚基结合,抑制肽酰基转移酶,从而抑制蛋白质合成,20μg/mL(乙醇溶液);

2.5卡那霉素(knamycin,Km):

与细菌核蛋白体蛋白基结合,并与较小的RNA亚基编译区的特定碱基结合,从而抑制蛋白质合成,25~50μg/mL(水溶液);

;(二)裂解细胞(Celllysis):

1.化学方法:

1.1CTAB裂解法:

CTAB(cetyltriethyammoniumbromide,十六烷基三甲基溴化铵),阳离子去污剂,与核酸形成复合物,在高盐溶液(>0.7mol/LNaCl)中稳定,在低盐溶液(≤0.3mol/LNaCl)中沉淀。

1.2SDS裂解法:

SDS(sodiumdodecylsulfate,十二烷基磺酸钠),阴离子去垢剂,蛋白质变性剂,有效沉淀多糖,与K离子??成絮状沉淀,广泛用于质粒(plasmid)DNA的提取,蛋白质的分离纯化。

;2.酶裂解方法:

2.2蛋白酶K(ProteinaseK)裂解法:

用于水解蛋白质,特别是与DNA结合紧密的组蛋白(Histone),广泛用于动物组织基因组DNA的提取,通常与SDS,Tris-Cl及EDTA共同裂解细胞。

2.3溶菌酶(lysozyme)裂解法:

通常用于细菌裂解,提取质粒DNA,其原理是破坏细菌细胞壁的肽聚糖支架,通过低渗透压使细胞胀裂,引起细胞裂解。作用条件温和,pH6.0~7.0,室温25℃。;(三)DNA的分离和抽提;2.氯化铯密度梯度离心法(CsCldensitygradientcentrifugation);

3.固相萃取法(solidphaseextraction,SPE);

;离心技术在基因工程中的应用(ApplicationofCentrifugationtechniques);(四)DNA的纯化(purification)和浓缩(condense);琼脂糖电泳(Agarosegelelectrophoresis);2.琼脂糖凝胶浇灌并冷凝;3.移走梳子,暴露出上样孔;4.琼脂糖胶放置在电泳缓冲液中;5.上样,通电流,直至DNA迁移到适当位置;6.在紫外光(UV)下观察DNA电泳情况;DNA电泳完毕后的琼脂糖凝胶;在紫外光(UV)下观察DNA电泳情况;不同凝胶的DNA电泳情况;电泳仪(电源和电泳槽);离子交换柱层析纯化DNA;2.DNA的浓缩:

2.1乙醇(Ethanol)沉淀法;

2.2正丁醇(butylalcohol)抽提法;

2.3聚乙二醇(PEG6000)浓缩法;;第三节人工合成核酸片段;PCR技术简史;PCR

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