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翅果油树基因家族与维生素E合成调控机制研究
目录
一、文档概要．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3
1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5
1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6
1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7
1.4技术路线与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9
1.5创新点与预期成果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11
二、翅果油树基因组与基因家族鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12
2.1基因组数据来源与预处理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16
2.2基因家族成员的识别与筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17
2.3基因家族序列特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.4基因家族染色体定位与结构域预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18
2.5基因家族进化关系分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22
三、翅果油树维生素E合成相关基因家族鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24
3.1维生素E合成途径概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27
3.2参与维生素E合成的关键酶基因家族识别．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31
3.3基因家族成员理化性质与保守基序分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32
3.4基因家族系统发育与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35
3.5基因家族在染色体上的分布与复制事件分析．．．．．．．．．．．．．．．．37
四、翅果油树维生素E合成基因家族的表达模式分析．．．．．．．．．．．．．38
4.1材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39
4.2不同组织中的基因表达谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40
4.3逆境胁迫下基因表达响应特征．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43
4.4维生素E含量与基因表达的相关性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45
4.5关键基因的时空表达验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49
五、维生素E合成关键基因的调控网络解析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52
5.1启动子顺式作用元件预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53
5.2转录因子结合位点分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．55
5.3基因共表达网络构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．58
5.4蛋白质互作网络预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．60
5.5关键调控模块的验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．62
六、维生素E合成关键基因的功能验证．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．64
6.1基因克隆与载体构建．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66
6.2植物表达体系的转化与筛选．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．66
6.3转基因株系的表型与代谢物分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．68
6.4基因功能缺失与过表达实验．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．74
6.5维生素E合成通路的调控效应．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．76
七、讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．78
7.1基因家族进化特征与功能分化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．80
7.2维生素E合成调控的关键因子．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．82
7.3基因表达与环境互作的机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．86
7.4研
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