第八章基因表达数据分析.pptVIP

第1页，共31页，星期日，2025年，2月5日Where?Go?第2页，共31页，星期日，2025年，2月5日生物信息学和基因芯片是新内容;生物信息学基因芯片促进丰富第3页，共31页，星期日，2025年，2月5日提纲一基因芯片简介(1)基因芯片的发展历史(2)基因芯片的分类(3)基因芯片的基本原理(4)基因芯片的技术流程(5)基因芯片的应用二生物信息学在基因芯片中的应用(1)基因芯片数据流关系图(2)生物信息学在基因芯片中的应用第4页，共31页，星期日，2025年，2月5日一基因芯片简介第5页，共31页，星期日，2025年，2月5日1.基因芯片的发展历史SouthernNorthernBlotDotBlotMicroarrayMicroarray高通量、自动化、灵敏度高第6页，共31页，星期日，2025年，2月5日2.基因芯片的分类(一)按载体材料分类玻璃芯片、硅芯片、陶瓷芯片。(二)按点样方式分类原位合成芯片、点样芯片。(三)按基因芯片的使用功能测序芯片、表达谱芯片、基因差异表达分析芯片。第7页，共31页，星期日，2025年，2月5日3.基因芯片的基本原理基因芯片（genechip），又称DNA微阵列（microarray），将大量探针以高密度固定于支持物上，然后与标记的核酸样品进行杂交，通过检测杂交信号的强弱进而判断样品中靶分子的数量。基因芯片的基本原理:碱基互补匹配。第8页，共31页，星期日，2025年，2月5日基因芯片荧光标记的样品共聚焦显微镜获取荧光图象杂交结果分析探针设计杂交第9页，共31页，星期日，2025年，2月5日4.基因芯片的技术流程芯片制作、样品制备、分子杂交、信号检测与结果分析第10页，共31页，星期日，2025年，2月5日基因芯片荧光标记的样品共聚焦显微镜获取荧光图象杂交结果分析探针设计杂交第11页，共31页，星期日，2025年，2月5日第12页，共31页，星期日，2025年，2月5日芯片制作第13页，共31页，星期日，2025年，2月5日样品准备样品的分离纯化：DNA,mRNA扩增：PCR,RT—PCR，固相PCR样品的标记：荧光标记（常用Cy3、Cy5）第14页，共31页，星期日，2025年，2月5日分子杂交第15页，共31页，星期日，2025年，2月5日信号检测与结果分析第16页，共31页，星期日，2025年，2月5日5.基因芯片的应用测序、表达谱分析、基因表达差异分析第17页，共31页，星期日，2025年，2月5日基因芯片测序流程第18页，共31页，星期日，2025年，2月5日基因芯片用于基因诊断:通过基因芯片诊断地中海贫血患者的血液细胞发现在B-珠蛋白基因中存在3个明确的突变位点.第19页，共31页，星期日，2025年，2月5日二、生物信息学在基因芯片中的应用提取什么信息如何提取信息如何处理和利用信息确定芯片检测目标芯片设计数据管理与分析第20页，共31页，星期日，2025年，2月5日探针设计解决杂交条件一致性问题芯片优化提高芯片制备效率公共数据库专用数据库确定目标选择待检测的目标序列数据分析分析杂交检测结果及可靠性基因芯片数据库图像处理数据库查询序列分析生物信息学数据挖掘数据可视化杂交检测图像基因芯片数据流图1.基因芯片数据流关系图第21页，共31页，星期日，2025年，2月5日体现在三个方面:芯片设计可靠性分析数据分析2.生物信息学在基因芯片中的应用第22页，共31页，星期日，2025年，2月5日