蕈树TCP基因家族鉴定及组织表达分析.pdfVIP

2025,54(3):249～260.

SubtropicalPlantScience

蕈树TCP基因家族鉴定及组织表达分析

1,21,31451*

王安邦，叶兴状，杨巧莹，刘美利，陈志云，张国防

(1.福建农林大学林学院，福建福州350002；2.福建农林大学生命科学学院，福建福州350002；3.福建省亚热带植物研究所/福

建省亚热带植物生理生化重点实验室，福建厦门361006；4.福建省泰宁国有林场，福建三明354400；5.福建省邵武卫闽国有林场，

福建南平354000)

摘要：TCP基因家族在植物叶形建成方面具有重要调节功能。以蕈树Altingiachinensis全基因组数据为依据，利用生

物信息学方法，对AcTCP基因家族进行鉴定，并对其基因结构、蛋白理化性质、染色体和蛋白亚细胞定位、共线性、

启动子顺式作用元件和转录组表达模式进行分析。结果表明，从蕈树基因组中鉴定到21个AcTCPs。所有AcTCPs均含

有TCPsuperfamily结构域，只有AcTCP3单独具有nitrilasesuperfamily结构域。蕈树TCPs分为PCF

(AcTCP1/2/3/4/7/8/9/11/12/17/20/21)、CIN(AcTCP5/6/13/15/16/19)和CYC/TB1(AcTCP10/14/18)3类。AcTCPs蛋白包含

197～554个氨基酸，亚细胞定位除AcTCP3位于细胞膜，其余均位于细胞核，均为不稳定亲水蛋白。AcTCPs基因的启

动子含有光、激素、胁迫及生长发育相关元件。转录组表达分析表明，AcTCPs基因存在组织特异性，其中AcTCP6/7/16

在叶-Ⅰ(3月取样)中特异高效表达，但同一亚家族大部分成员的表达模式相似。从21个AcTCPs成员中挖掘出AcTCP16、

AcTCP19和AcTCP20三个与蕈树叶形发育相关的关键潜在基因，推测蕈树TCPs在光、植物生长发育、激素和胁迫响

应中发挥重要作用。

关键词：蕈树；TCP基因家族；生物信息学；组织表达

Doi:10.3969/j.issn.1009-7791.2025.03.002

中图分类号：Q943文献标识码：A文章编号：1009-7791(2025)03-0249-12

Genome-wideIdentificationandTissueExpressionAnalysisoftheTCPGene

FamilyinAltingiachinensis

1,21,31451*

WANGAn-bang,YEXing-zhuang,YANGQiao-ying,LIUMei-li,CHENZhi-yun,ZHANGGuo-fang

(1.CollegeofForestry,FujianAgricultureandForestryUniversity,Fuzhou350002,FujianChina;2.CollegeofLifeSciences,Fujian

AgricultureandForestryUniversity,Fuzhou350002,FujianChina;3.FujianInstituteofSubtropicalBotany/