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菌种资源遗传特性研究及其生物多样性价值评估

目录

文档概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1.1菌种资源的重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

1.1.2遗传特性研究的必要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.1.3生物多样性价值评估的紧迫性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

1.2.1菌种资源收集与保存．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

1.2.2菌种遗传特性分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.2.3生物多样性价值评估方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

1.3研究目标与内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

1.3.1研究目标．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

1.3.2研究内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

1.4研究方法与技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

1.4.1研究方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

1.4.2技术路线．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

菌种资源收集与鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

2.1样本采集地点与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

2.1.1采样地点选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

2.1.2采样方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

2.2菌种分离与纯化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．29

2.2.1菌种分离技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

2.2.2菌种纯化方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

2.3菌种鉴定与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

2.3.1形态学鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．34

2.3.2分子生物学鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.4菌种保藏与管理．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.4.1保藏方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

2.4.2管理系统．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

菌种遗传特性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

3.1基因组测序与分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

3.1.1基因组测序技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

3.1.2基因组组装与注释．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

3.2遗传多样性分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

3.2.1DNA指纹图谱分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．48

3.2.2多重序列比对分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．51

3.3重要基因功能研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．52

3.3.1基因功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．