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全基因组解析:向日葵MLO基因家族的鉴定与功能研究
目录
内容综述................................................3
1.1研究背景与意义.........................................4
1.1.1向日葵的生物学特性与经济价值.........................8
1.1.2MLO基因家族的生物学功能概述..........................9
1.1.3本研究的目的与意义..................................10
1.2国内外研究进展........................................10
1.2.1MLO基因家族的结构与功能研究.........................12
1.2.2MLO基因家族在其他植物中的功能解析...................15
1.2.3向日葵MLO基因家族研究现状...........................16
1.3研究内容与方法........................................17
1.3.1研究目标............................................19
1.3.2研究策略............................................20
1.3.3技术路线............................................20
材料与方法.............................................22
2.1实验材料..............................................23
2.1.1向日葵种质资源......................................24
2.1.2实验试剂与仪器......................................26
2.2实验方法..............................................33
2.2.1全基因组测序与组装..................................34
2.2.2MLO基因家族成员鉴定.................................35
2.2.3MLO基因家族的生物信息学分析.........................36
2.2.4MLO基因家族的表达模式分析...........................37
2.2.5MLO基因家族功能验证.................................41
结果与分析.............................................42
3.1向日葵基因组组装质量评估..............................43
3.2MLO基因家族成员鉴定与基本特征分析.....................44
3.2.1基因数量与分布......................................45
3.2.2基因结构特征........................................48
3.2.3蛋白质理化性质分析..................................49
3.3向日葵MLO基因家族的系统发育分析.......................50
3.4向日葵MLO基因家族的保守基序分析.......................51
3.5向日葵MLO基因家族的表达模式分析.......................52
3.5.1组织特异性表达......................................54
3.5.2发育阶段特异性表达..................................55
3.5.3逆境胁迫下表达分析..................................56
3.6向日葵MLO基因家族功能验证.............................58
3.6.1过表达植株表型观察..................................58
3.6.2相关生理指标测定...................................
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