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分子植物育种，2021年，第19卷，第13期，第4517-4524页

MolecularPlantBreeding,2021,Vol.19,No.13,4517-4524

研究报告

ResearchReport

基于SLAF-seq技术的闽楠SNP标记开发及遗传多样性分析

李娟林建勇欧汉彪刘雄盛姜英梁瑞龙’

广西壮族自治区林业科学研宄院，国家林业局中南速生材繁育实验室，广西优良用材林资源培育重点实验室，南宁,530002

*通信作者，Hangruilong@126.com

摘要利用简化基因组测序技术SLAF-seq,对广泛分布在长江以南地区8个省份的33份闽楠种质进行

SNP标记开发、指纹图谱构建和遗传多样性分析。本研究对各样品的测序数据进行统计，共获得107.52Mb

CleanReads数据，每个样品的SNP标记数目介于309012~540030之间，样本平均测序质量值Q30为

93.78%,平均GC含量为40.90%。共获得丨072115个SLAF标签，其中多态性SLAF标签275389个。通过序

列分析，获得121352个有效的单核苷酸多态性标记(SNP);经过指纹图谱严格的过滤条件,筛选出3452个

SNP位点作为指纹图谱SNP。利用开发的SNP分子标记，将33份闽楠种质资源分为3个亚群，这3个亚群

分别包含材料为Q1:17个,Q2:11个,Q3:5个。通过进一步过滤，获得270个核心SNP标记作为指纹图谱

的核心标记，可用于品种种质的鉴定。研宄结果表明，简化基因组测序技术SLAF-seq能高效、低廉地开发出

大量SNP标记，是一种适用于闽楠种质资源遗传分析的有效工具；利用筛选出的核心SNP分子标记构建

闽楠DNA指纹图谱，为SNP分子标记应用于闽楠种质鉴定、闽楠品种改良与优质品种选育提供依据，也有

利于闽楠种质的高效利用及杂种优势群的建立。

关键词闽楠；SLAF-seq;SNPs标记;指纹图谱;遗传多样性

MarkerDevelopmentandAnalysisofGeneticDiversityofPhoebebournei

GermplasmsUsingSLAF-seqTechnology

LiJuanLinJianyongOuHanbiaoLiuXiongshengJiangYingLiangRuilong*

GuangxiKeyLaboratoryofSuperiorTimberTreeResourcesCultivation,KeyLaboratoryofCentralSouthFast-growingTimberCultivation,Guangxi

ForestryResearchInstitute,Nanning,530002

*Coespondingauthor,liangruilong@126.com

DOI:10.13271/j.mpb.019.004517

AbstractInthisstudy,aspecificlocusamplifiedfragmentsequencing(SLAF-Seq)technologywasusedtodevelop

SNPmarkers,constructfingerprintmaps,andanalyzethegeneticdiversityof33Phoebebourneigermplasms

distributedin8provincessouthoftheYangtzeRiver.Inthisstudy,sequencingdataofeachsamplewasstatistically

analyzed,and107.52MbReadsdatawereobtained.TheReadsdataofeachsamplerangedfrom309012to

540030.Theaveragesequencingqualityvalue(Q30)andGCcontentofsampleswas93.78%and40.90%,the

totalof10