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http://aammt.tmmu.edu.cn陆军军医大学学报,2024,46(10)1083
DOI:10.16016/j.20970927.202303097
小鼠胚肾发育过程中细胞衰老相关基因差异表达分析
罗佳,汪晓月,喻芳,陈娟,陈客宏,何娅妮,陈佳400042重庆,陆军特色医学中心肾内科,创伤与化
学中毒国家重点实验室
[摘要]目的通过转录组学筛选胚肾发育过程中的差异表达基因,采用生物信息学分析细胞衰
老途径及其相关基因,进一步探讨细胞衰老与胚肾发育的关系。方法分别取胚龄为14.5d(E14.5
组)和18.5d(E18.5组)的小鼠肾脏组织,使用过碘酸雪夫染色观察肾脏组织结构,通过转录组学分析
胚肾发育过程中基因谱表达变化,采用生物信息学分析细胞衰老相关基因表达变化,并采用实时定量荧
光PCR及Westernblot验证靶基因的表达水平。结果随着胚肾的发育,肾脏结构逐渐成熟,转录组学
结果及生物信息学分析发现细胞衰老相关基因在胚肾发育过程中发挥重要作用,其中E18.5组中细胞
衰老相关基因Cdkn1a(P21)mRNA及蛋白相对表达水平较E14.5组升高(P<0.05),而Skp2、Ccne1、
Ccnd2和Cdk4mRNA表达水平较E14.5组降低(P<0.05)。结论在胚肾发育过程中细胞衰老相关基
因表达水平发生显著变化,表明细胞衰老在胚肾发育过程中发挥重要作用。
[关键词]胚肾发育;细胞衰老;转录组学测序;生物信息学分析
[中图法分类号]R321.5;R322.61;R394.1[文献标志码]A
Differentialexpressionofgenesrelatedtocellularsenescenceduringembryonic
kidneydevelopmentinmice
LUOJia,WANGXiaoyue,YUFang,CHENJuan,CHENKehong,HEYani,CHENJiaStateKeyLaboratoryof
TraumaandChemicalPoisoning,DepartmentofNephrology,ArmyMedicalCenterofPLA,Chongqing,400042,China
[Abstract]ObjectiveToanalyzethecellularsenescencepathwaysandtheirassociatedgeneswith
bioinformaticanalysisbyscreeningdifferentiallyexpressedgenes(DEGs)duringembryonickidney
developmentwithaidoftranscriptomicsinordertoexploretherelationshipbetweencellularsenescenceand
embryonickidneydevelopment.MethodsAfterthekidneytissuesfrommiceatembryonicageof14.5days
(E14.5group)and18.5days(E18.5group)werecollected,thekidneytissuestructurewasobservedwith
periodicacidSchiff(PAS)staining,theexpressionprofilesoftherelatedgenesduringembryonickidney
developmentwereanalyzedbytranscriptomics,andthechangesinthegenesrelatedtocellularsenescence
werefurtheranalyzedwithbioinformatics.Theexpressionlevelsoftargetgeneswereverifiedbyrealtime
quantitativefluorescencePCRandWesternblotting.ResultsWiththedevelopmentoftheembryonic
kidney,thekidneystructuregraduallymatured.Theresultsoftr
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