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吐鲁番黑羊体重与体尺性状的全基因组关联研究

目录

吐鲁番黑羊体重与体尺性状的全基因组关联研究（1）．．．．．．．．．．．．3

一、文档综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

（一）研究背景．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．3

（二）研究意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

（三）研究目的和问题．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．5

二、材料与方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

（一）样本来源与选取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

（二）基因组DNA的提取．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

（三）基因组测序．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．9

（四）基因型鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．10

（五）统计分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

三、结果．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

（一）基因组数据的质量评估．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

（二）体重与体尺性状的遗传分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

（三）全基因组关联分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．17

（四）基因-性状关联信号的显著性检验．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

四、讨论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

（一）遗传变异与性状关联．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

（二）基因互作网络．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

（三）环境因素的考虑．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．23

（四）研究结果的局限性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

五、结论．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．25

（一）主要研究发现．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．26

（二）对吐鲁番黑羊育种的启示．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

（三）未来研究方向．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

吐鲁番黑羊体重与体尺性状的全基因组关联研究（2）．．．．．．．．．．．31

一、文档概览．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

1.1吐鲁番黑羊品种重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

1.2体重与体尺性状在育种中的价值．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．33

1.3全基因组关联研究在畜牧业的现状与发展趋势．．．．．．．．．．．．．．35

二、文献综述与现状分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

2.1吐鲁番黑羊品种特征及遗传研究进展．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.2体重与体尺性状遗传学研究概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

2.3全基因组关联分析在动物育种中的应用与局限．．．．．．．．．．．．．．39

三、研究方法与数据来源．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

3.1研究对象及样本选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．41

3.2数据收集与实验设计．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．42

3.3基因组测序与数据分析方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

3.4统计分析软件及工具选择．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

四、全基因组关联分析过程与实施．．．．．．．．．．．．．