基于加权基因共表达网络分析探讨与脓毒症预后相关的关键差异基因.pdfVIP

2024年12月湘南学院学报（医学版）Dec.,2024

第26卷第4期JournalofXiangnanUniversity(MedicalSciences)Vol.26No.4

基于加权基因共表达网络分析探讨与脓毒症预后相关的

关键差异基因

121*1111

钟树武，李静，张群峰，谢鹏，言彩红，黄治家，陆洲成

1.南华大学附属第二医院，湖南衡阳421099；2.南华大学附属南华医院，湖南衡阳421002

摘要：目的基于生物信息学分析研究与脓毒症诊断及预后相关的关键基因。方法从GEO数据库中下载5个

脓毒症芯片数据集，通过差异分析和WGCNA方法筛选脓毒症关键差异基因。对差异基因进行GO和KEGG功能富集

分析。在STRING数据库中构建并下载PPI网络，使用Cytoscape软件获取关键基因，使用ROC曲线评价基因的诊断

价值。使用K-M生存分析和WGCNA寻找预后相关的核心基因。使用CIBERSORT算法进行免疫细胞比例评估。结果

对3个研究组数据集进行差异分析，得到467个共同差异表达基因（DEGs），WGCNA筛选出389个脓毒症相关基因，

重叠后得到189个脓毒症相关的EDGs。这些差异基因GO主要富集到髓系白细胞活化、细胞因子分泌的正向调节等；

KEGG主要富集到Th1和Th2细胞分化、Th17细胞分化等通路上。使用MCC算法筛选出10个关键基因，这些基因均

在研究组和验证组数据集中，均表现出良好的诊断价值，ROC曲线的AUC均0.7。使用K-M曲线和WGCNA筛选出

3个与预后相关的核心基因，分别为CCL5、MMP-8和RETN。MMP8高、低表达组的差异基因的GO主要富集到细菌的

防御反应、参与免疫反应的白细胞活化等；KEGG主要富集到p53信号通路、FoxO信号通路等。CCL5、MMP-8和RETN

表现出与免疫细胞含量密切相关。结论通过筛选得到10个脓毒症相关的核心差异基因，其中CCL5、MMP8和RETN

可能是脓毒症患者的预后因子。

关键词：脓毒症；预后；生物信息学分析；WGCNA；关键基因

中图分类号：R459.7文献标志码：A文章编号：1673-498X（2024）04-0007-09

doi:10.16500/ki.1673-498x.2024.04.002

Exploringthekeydifferentialgenesassociatedwithsepsis

prognosisBasedonweightedgeneco-expressionnetworkanalysis

ZhongShuwu,LiJing,ZhangQunfeng,etal.

TheSecondAffiliatedHospitalofNanhuaUniversity,Hengyang,Hunan421099,China

Abstract:ObjectiveTostudythekeygenesrelatedtothesepsisdiagnosisandprognosisbasedon

bioinformaticsanalysis.MethodsFivesepsismicroarraydatasetsweredownloadedfromtheGEOdatabaseand

screenedforsepsiskeydifferentialgen