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#专业术语#环状RNA简介

泊客

环状RNA是在真核生物中发现的一类闭合环状的RNA分子，是非编

码RNA研究领域的又一个热点。多数环状RNA均来自于蛋白编码区

域，但是目前仍未检测到环状RNA的蛋白质产物，因此将之归为非编

码RNA。

基于高通量的环状RNA发现过程

2012年，PatrickO.Brown研究组在PlosOne的一项研究首次证实

在不同类型的细胞状RNA均是人类的一类主导型的产

物。2013年，Rajewsky,N研究组在Nature中的研究证明不光是

在人类，在小鼠和线虫体内均环状RNA均广泛存在，该文章使得环状

RNA引起了广泛关注。

环状RNA的预测方法

2013年，Rajewsky,N研究组在人、小鼠和线虫中均预测了上千种环状

RNA，主要是基于组注释文件以及不能比对到组上的序

列进行环状RNA预测的。2014年，Bartel,DP研究组在GenomeBiology

了一个预测环状RNA的新方法，该方法不依赖于已知组的基

因注释信息，因此预测的环状RNA不局限于组上的编码区。2015

年，FangqingZhao研究组在GenomeBiology了一个预测环状

RNA的新算法，CIRI，该算法通过多重过滤策略利用RNA-seq数

据预测环状RNA，通过该算法，在人类转录组中发现了较多的内含子

区以及间隔区环状RNA。

环状RNA生物学功能

基于数据，已预测了较多的环状RNA，但是绝大多数环状RNA

功能目前并不清楚。2013年，Rajewsky,N研究组通过实验证实，环状

RNA可以作为miRNAsponge，通过与miRNA结合，发挥生物学功能。

2015年，GeShan研究组在NatureStructuralMolecularBiology

的研究中，外显子-内含子环形RNA（EIciRNA）可以调控其自身

所在的的表达，进一步的研究表明外显子-内含子环形RNA是通

过招募U1小RNA蛋白复合物（U1snRNP）来促进转录的起始。

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