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系统生物学与网络分析
网络构建与分析
在网络分析中,我们通常将生物系统中的分子相互作用表示为网络图。这些网络可以是蛋白质-蛋白质相互作用网络、基因调控网络、代谢网络等。网络分析的目标是通过图论和复杂网络理论来理解这些相互作用的模式和功能。
网络构建
网络构建的第一步是从实验数据中提取相互作用关系。这些数据可以来自高通量测序、质谱分析、ChIP-seq等实验技术。然后,我们可以使用生物信息学工具将这些数据转化为网络图。
数据预处理
在构建网络之前,数据的预处理是必不可少的。这包括数据清洗、格式转换和标准化等步骤。例如,从蛋白质-蛋白质相互作用数据中,我们需
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