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白癜风患者肠道微生物及代差异进展研究

目录

内容综述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1研究背景与意义．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．4

1.1.1白癜风疾病概述．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．6

1.1.2肠道微生态学重要性．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．7

1.2国内外研究现状．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．8

1.2.1白癜风与微生物关联性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．11

1.2.2肠道菌群在不同人群中的分布．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．12

1.3研究目的与主要内容．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．13

白癜风与肠道微生态关系基础．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．14

2.1白癜风发病机制探讨．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．15

2.1.1免疫学机制．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．16

2.1.2神经化学及内分泌因素．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．18

2.2肠道微生态组成与功能．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．19

2.2.1主要菌类及其生理作用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．20

2.2.2肠道免疫轴理论基础．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．21

肠道微生物组分析技术．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．22

3.1样本采集与预处理方法．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．24

3.1.1粪便样本获取规范．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．27

3.1.2实验室前处理流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

3.2微生物基因组测序策略．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．28

3.2.1高通量测序技术应用．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．30

3.2.216SrRNA基因测序分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．31

3.3数据分析处理流程．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．32

3.3.1物种注释与分类．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．35

3.3.2多样性与丰度统计分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．36

白癜风患者肠道菌群特征分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．37

4.1肠道菌群结构差异比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．38

4.1.1α多样性指数分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．39

4.1.2β多样性群落结构比较．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．40

4.2关键菌属/种的丰度变化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．43

4.2.1常见优势菌群变化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．44

4.2.2特异性差异菌种鉴定．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．45

4.3功能预测分析．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．46

4.3.1肠道菌群代谢功能预测．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．47

4.3.2与疾病相关的代谢通路变化．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．49

肠道菌群与白癜风病情的相关性研究．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．53

5.1菌群特征与皮损状态关联．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

5.1.1不同分期/类型的菌群差异．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．．54

5.1.2病情活动性与菌群稳定性关系．．．．．．．．