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GBFF格式中部-特性表关键词misc_RNA无法用RNA关键词描述的转录物或RNA产物prim_transcript初始转录本precursor_RNA前体RNAmRNA信使RNA5clip前体转录本中被剪切掉的5’端序列3clip前体转录本中被剪切掉的3’端序列5UTR5’非翻译区3UTR3’非翻译区exon外显子CDS蛋白质编码序列sig_peptide编码信号肽的序列transit_peptide转运蛋白编码序列mat_peptide编码成熟肽的序列intron内含子polyA_siteRNA转录本的多聚腺苷酸化位点rRNA核糖体RNAtRNA转运RNAscRNA小细胞质RNAsnRNA小核RNAsnoRNA加工和修饰rRNA的小核RNA第62页,共123页,星期日,2025年,2月5日GBFF格式中部-特性表关键词immunoglobulin_relatedC_region免疫相关蛋白上的稳定区D_segment码免疫球蛋白重链的可变区基因之一J_segment编码免疫球蛋白轻链和重链的可变区基因之一N_region插入重排免疫球蛋白片段间的核苷酸S_region免疫球蛋白重链的开关区V_region免疫球蛋白轻链和重链的可变区,和T-细胞受体α,β和γ链;编码可变的氨基末端部分;可由V_segment,D_segment,N_region和J_segment组成V_segment免疫球蛋白轻链和重链的可变区段,和T-细胞受体α,β和γ链;编码大多数可变区(v_region)和前导肽的最后几个氨基酸repeat_region基因组中所包含的重复序列第63页,共123页,星期日,2025年,2月5日GBFF格式中部-特性表关键词repeat_unit单个的重复元件LTR长末端重复序列Satellite卫星重复序列misc_binding无法描述的核酸序列结合位点primer_bind复制、转录的引物结合位点protein_bind蛋白质结合区STS测序标签位点misc_recomb无法用重组特性关键词描述的重组事件iDNA通过重组所消除的DNAmisc_structure无法用结构关键词描述的核酸序列高级结构或构型stem_loop发夹结构D-loop线粒体中DNA中的取代环第64页,共123页,星期日,2025年,2月5日GBFF格式中部-Location2、特性位置(Location):用来描述在序列中的什么区域能够找到相关的特性,位置特性可以包含Complement、Join、Order等三个操作符(Operator)。467指明序列中的单个碱基340..565指明包括起始和中止碱基在内的一段连续序列345..500指明序列起始于起始碱基号之前的某个位置,但起始碱基号之前的特性边界未知第65页,共123页,星期日,2025年,2月5日GBFF格式中部-Location1..888指明特性起始于第一个已测序的碱基之前(102.110)指明正确位置未知,但包含在102和110号碱基之间(23.45)..600指明序列特性起始碱基在23和45碱基之间,终止于600号碱基(122.133)..(204.221)指明序列特性起始于122和133碱基之间,终止于204和221号碱基之间123^124指明123和124号碱基之间
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