临床科研思路-非编码RNA与自身免疫病-精品医学课件.pptVIP

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Part3.在经费紧张的条件下追踪热点研究NucleusCytoplasm1.cotranscriptionregulation共转录调节2.bindtotranscriptionfactors影响转录因子的结合3.bindtochromatinregulators影响染色质状态4.formsubnucleusbodies形成亚核结构2.structuralorororganizationalrole作为分子组装的平台1.modulateproteinactivityandlocation影响蛋白活性、定位3.modulatealternativesplicing,translation影响选择性剪切、翻译4.asmicroRNAsponges与microRNA结合,影响其功能发挥lncRNA参与基因表达调控的多个环节*数据挖掘:参与免疫系统功能的重要lncRNA筛选出狼疮相关长链非编码RNA表达差异最显著的lncRNA疾病活动性相关的lncRNA疾病遗传相关的lncRNA功能缺失和功能获得研究策略ASO,siRNA,CRISPR细胞分子表型、整体表型lncRNA作用的分子机制:RIPRNA-pulldownChIRP狼疮相关lncRNA的研究策略*检测了319个miRNA,病人中有统计学差异的82个,其中升高2倍(绿色点)以上的7个,降低1.5倍以上者41个。*EffectsofmiR-146aontheactivationofthetypeIIFNpathway.(A)OverexpressionofmiR-146arepressestheproductionoftypeIIFNs.PBMCsobtainedfromahealthydonorwereelectroporatedwithanexpressionplasmidformiR-146a,followedbystimulationwithR837for2hours.ShownistherelativemRNAquantificationofIFNαandIFNβ.TheIFNαprimersweredesignedtorecognizemostIFNαsubtypes.(B)SilencingofmiR-146aaugmentstheproductionoftypeIIFNs.PBMCsweretransfectedwithaninhibitoragainstmiR-146aorscrambledcontrololigonucleotides,followedbystimulationwithR837for2hours.ShownaretherelativemRNAlevelsofIFNαandIFNβ.*miR-146ainhibitstheactivationdownstreamoftypeIIFNinvitro.293T/ISREcellsweretransfectedtoexpressmiR-146afollowedbyincubationwithtypeIIFNfor6hours.TheactivityoftheISREluciferasereportergenewasthenmeasured.Dataareshownasthemean±SEM.(D)miR-146ainhibitstheactivationdownstreamoftypeIIFNinprimaryimmunecells.PBMCsfromasecondhealthydonorweretransfectedtoexpressmiR-146afollowedbyincubationwithtypeIIFNfor6hours.ThemRNAlevelsofthreeIFN-induciblegeneswerequantified.*选取一例IFNscore较高的病人转染对照空载,可见一些IFN诱导基因表达很高而转染miR-146a后则这几个IFN诱导基因表达被显著抑制在其他两例病人中也得到一致结果*

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