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基于转录组数据的黄花菜EST-SSR位点的生物信息学分析
摘要:黄花菜也叫安神菜、忘忧草或柠檬萱草等,属于百合目百合科植物。其营养丰富,食用价值高,而且具药用价值功效REF_Ref2535\n[11],深受人们喜爱,能带来可观的经济效益。基于转录组数据的黄花菜EST-SSR位点的生物信息学相关分析可以在黄花菜的遗传研究开展、优质黄花菜筛选等方面起到重要的理论支持的作用。首先通过Illumina平台的取得黄花菜的转录组数据,然后其拼接组装,分析其生物信息学信息。转录组处理、拼接组装获得193337条unigenes。用MISA对进行SSR位点的检测,最终在32352条unige
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