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新冠核酸检测无内参原因
大家在做新冠核酸检测的时候经常会碰到一个问题:某个反应孔
的内参没有曲线,甚至整板的内参都不起,往往这时大家第一个想到
的就是标本不合格,需要重新采样,其实不然,内参基因无扩增曲线
的原因有很多,需要具体情况具体分析。
首先,我们先要搞明白什么是内参?新冠核酸检测中的内参分为
两种,一种是内源性内参,另一种是外源性内参。
内源性内参其实就是人体组织和细胞中表达比较恒定的管家基
因,常用的管家基因包括GAPDH、BETA-actin、18sRNA、B2M、HPRT
和TBP等。内源性内参可以监测标本的采集、检测、扩增等各个环
节。因此,内源性内参的应用比较广泛。
外源性内参,是一种人工设计合成的与模板扩增效率相似的基因
片段,需要额外加到提取溶液中,外源性内参由于是人工设计的基因
片段,其扩增效率与靶基因相近,因此能够更好地反应核酸提取及扩
增的过程。
在搞清楚上述两个概念之后,我们再来分析一下新冠核酸检测中
无内参的原因:
01标本采集的原因
标本采集不合格可能会导致内参基因无扩增曲线,原因在于未
采集到足够的细胞,核酸提取后内参基因片段极少,导致内参基因无
法正常扩增。
但是,当下应检尽检、愿检尽检所使用的采样管通常是10合
1或20合1的采样管,这种情况下,因标本采集不合格引起内源
性内标无扩增曲线的情况极为少见。
应当注意的是,当样本的内源性内参基因的扩增曲线Ct值偏
大,或者曲线较早地进入平台期时,都要引起注意。前者可能是由于
采集的样本中细胞较少造成的,后者提示样本中可能存在抑制物,抑
制PCR的反应。
在这需要说明的是外源性内参只参与提取和扩增的过程,不能检
测标本的采集,这也是外源性内参的一大缺点。
02核酸提取的原因
由于现在要求核酸检测结果要及时发布,很多厂家不仅缩短了核
酸的扩增时间,提取的程序也大大缩短,通常磁珠法提取在30~
40分钟,目前很多厂家都能做到10~20分钟,但是,更快的提取
速度,并不能保证提取的质量。
曾在试验中发现,使用某种更快的磁珠法提取程序,会导致部分
样本的内参基因无扩增曲线,对比两种不同时间的程序发现,更快的
提取程序,磁珠与样本的孵育时间缩短,推测可能导致样本中的核酸
与磁珠结合较少,导致部分样本内参无扩增曲线或扩增曲线Ct值偏
大。
因此,建议实验室在更换更快的提取程序时,做好性能验证或性
能确认试验,以验证该程序是否能在本实验室检测系统中达到国家要
求的检测限。
03扩增试剂的原因
扩增试剂在引起检测结果无内参的原因主要有以下两方面:
未达到要求的反应体系,PCR反应体系要求比较严格,我们可以
了解一下PCR的标准反应体系:例如100uL的PCR反应液各成分
的浓度要求:①4种dNTP混合物各200umol/L;②引物各10
~100pmol;③模板DNA0.1~2ug;④TaqDNA聚合酶2.5U;⑤
Mg2+1.5mmol/L。
可以想象,在20~50uL的反应体系下,多加2uL或少加
2uL,反应液中反应物质的浓度会有较大的变化,因此,可能导致反
应不能正常进行。
扩增试剂的长时间高温放置会导致检测结果异常,扩增试剂要求
的保存温度通常是-15℃至-25℃,反复地冻融可能会导致酶
的失活或者或者探针的降解,导致反应不能正常进行。另外,同种试
剂的不同批号最好不要混合使用。
04人的因素
检验五大要素「人、机、料、法、环」中,人的因素排在第一位,
在导致核酸检测内参基因无曲线的原因中,人的因素主要表现在一下
几个方面:
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