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J.SHANXIAGRIC,UNIV.(NaturalScienceEdition)
学报(自然科学版)04255
2024,44(2)010
:
王伟杰,雷亚柯,张建航,等.花生GATA基因家族鉴定和表达分析[J].山西农业大学学报(自然科学版),2024,44(2):
10-22.
WangWJ,LeiYK,ZhangJH,etal.IdentificationandexpressionanalysisofpeanutGATAgenefamily[J].JournalofShanxi
AgriculturalUniversity(NaturalScienceEdition),2024,44(2):10-22.
doi:10.13842/ki.issn1671-8151.202312032
花生GATA基因家族鉴定和表达分析
王伟杰,雷亚柯,张建航,展世杰,邓陈威,贾朝阳*
(周口市农业科学院,河南周口,466000)
摘要:[目的]探究GATA基因家族在花生生长发育和抗旱调控中的作用。[方法]通过生物信息学方法鉴定花生
GATA家族成员,分析其系统进化、基因结构、组织表达模式,最后结合转录组数据和实时荧光定量PCR技术筛选花
生GATA家族响应干旱胁迫的关键基因。[结果]本文鉴定到47个GATA类转录因子编码基因,它们不均匀地分布在
除2号、4号和14号染色体以外的17条染色体上。理化性质分析表明,该家族属于亲水性蛋白,大部分基因呈酸性,只
有Arahy.QG9XFC.1具有信号肽。根据拟南芥家族同源基因聚类分析结果,可将花生GATA家族蛋白分为4个亚家
族。其中第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ亚家族成员的锌指结构域特征模体为CX2CX18CX2C,而第Ⅳ亚家族为CX2CX20CX2C类型。大部分成
员在A亚基因组和B亚基因组中呈对称分布,组织表达模式分析显示,超过半数的GATA家族成员在22个组织中表
现不同程度的特异性表达。其中第Ⅰ亚家族Arahy.LJYJ4M、Arahy.VS8GG1、Arahy.3S8P0L和Arahy.I6JZDT在
所有组织中均显示较高的表达水平。然而Arahy.QY7BN7和Arahy.F7WS4I在叶片,Arahy.C6NV9N在花被中表
达较高,Arahy.4Y7J59和Arahy.D56WMI在种子中呈现组织特异性高表达特性。转录组数据分析发现,34个GA⁃
TA基因响应干旱、低温、ABA和BR激素处理,5个GATA基因在干旱和低温胁迫下表达量发生显著上调,1个基因发
生显著下调。进一步RT-qPCR分析表明,Arahy.C6NV9N和Arahy.2SUK7S特异性响应PEG胁迫的基因,尤其前
者在叶组织中胁迫早期呈现持续上调表达。[结论]花生中有47个GATA基因,其中Arahy.C6NV9N和Ara⁃
hy.2SUK7S可能是花生GATA家族响应干旱胁迫关键基因。
关键词:花生;转录因子;GATA;组织表达模式;干旱胁迫
中图分类号:S565.2文献标识码:A文章编号:1671-8151(2024)02-0010-13
转录因子,又称反式作用因子,能够特异性识
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