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基于网络药理学的半枝莲治疗胰腺癌的作用机制研究
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徐亚晨谢毅强肖曼
[摘要]目的利用網络药理学技术与平台,挖掘半枝莲治疗胰腺癌的作用机制。方法基于TCMSP、NPASS、HIT、TCMID、TCM-ID及中国知网、万方数据知识服务平台、维普网、科学引文索引(SCI)、PubMed等数据库,检索半枝莲活性成分,检索时限为1971年6月—2019年10月。利用预测平台获取并筛选各组分靶基因,维恩分析筛选成分靶基因与胰腺癌特异性基因交互基因,通过成分-靶点-疾病交联确定重要成分及核心靶点,利用基因本体注释(GO)分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析半枝莲治疗胰腺癌的分子机制。结果获得半枝莲类药成分24种,提取交互基因73个,筛选出黄芩素、汉黄芩素、黄芩苷、槲皮素、豆甾醇5种重要成分及AKT1、HSP90A1、肿瘤坏死因子、ESR1、表皮生长因子受体、转录后基因沉默2、SRC、基质金属蛋白酶9、基质金属蛋白酶2、AR在内的10个核心靶点。GO功能富集于细胞凋亡、炎症与氧化应激反应的调节,参与蛋白质、ATP酶、DNA链特异性结合等。KEGG富集于癌症、胰腺癌、癌症蛋白多糖、Ras、磷脂酰肌醇-3-激酶-蛋白激酶B途径信号通路等。结论半枝莲可能通过多类靶点,调控多条信号通路,影响多重细胞的功能,从而起到治疗胰腺癌的作用,这也为临床发掘治疗胰腺癌的替代药物提供了理论支撑。
[关键词]网络药理学;半枝莲;胰腺癌;靶基因;富集
[]R285?????[]A?????[]1673-7210(2020)10(b)-0123-06
[Abstract]ObjectiveTostudythemechanismofactionofScutellariaeBarbataeHerbaintreatingpancreaticcancerbyusingnetworkpharmacology.MethodsBasedonTCMSP,NPASS,HIT,TCMID,TCM-ID,CNKI,WANFANGDATA,CQVIP,ScienceCitationIndex(SCI),PubMeddatabases.TheactiveconstituentsofScutellariaeBarbataeHerbaweresearchedfromJune1971toOctober2019.Thepredictionplatformwasusedtoacquireandscreentargetgenes.Vennanalysiswasusedtoscreeninteractiongenesbetweencomponenttargetgenesandpancreaticcancerspecificgenes,thendeterminedthekeytargetsofthedrugthroughdrug-target-diseasecross-linking.Thenfullyutilizedgeneontology(GO)analysisandkyotoencyclopediaofgenesandgenomes(KEGG)signalpathwayenrichmenttoanalyzemolecularmechanismofScutellariaeBarbataeHerbaintreatingthedisease.ResultsAtotalof24kindsofdrug-likecompoundswereobtained,73targetgenesweredetermined,fivecorecomponentsincludingbaicalein,wogonin,baicalin,quercetin,stigmasterol,andtenkeytargetssuchasAKT1,HSP90A1,tumornecrosisfactor,ESR1,epidermalgrowthfactorreceptor,post-transcriptionalgenesilencing2,SRC,matrixmetalloproteinase9,matrixmetalloproteinase2andARwerescreenedout.GOenriched
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