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聚丙烯酰胺凝胶电泳;1、作用
分离蛋白质、核酸
2、概念
聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)是以聚丙烯酰胺凝胶作为支持介质的一种电泳方法。聚丙烯酰胺凝胶具有机械强度好、有弹性、透明、化学性质稳定、对pH和温度变化小、没有吸附和电渗作用小的特点,是一种很好的电泳支持介质。
;聚丙烯酰胺凝胶由丙烯酰胺单体(Acr)和交联剂N,N’-亚甲基双丙烯酰胺(Bis)在催化剂作用下合成。
聚合后的聚丙烯酰胺凝胶形成网状结构,具有电荷效应、分子筛效应。;(1)丙烯酰胺结构式
;(2)亚甲双丙烯酰胺;PAGE的聚合;
注意:
?TEMED量多少都会影响催化作用,须在碱性条件下聚合
?分子氧存在,聚合不完全,须去除分子氧,隔绝氧
?升高温度能提高聚合,降低温度能延迟聚合
;(2)光聚合:核黄素-TEMED系统;;SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳;概述;基本原理;;实验原理;浓缩效应:不连续性所致
制胶缓冲液:Tris-HCl
(根据亚基分子量分离蛋白质)
(3)二硫键是否完全被还原
与蛋白质的结合量:大多数1.
(2)样品缓冲液的离子强度
混匀后,置真空干燥器中,抽气10min
圆盘电泳
不连续SDS
1967年由Shapiro建立。
注入电极缓冲液用
(3)二硫键是否完全被还原
选择适当的凝胶浓度。
(根据亚基分子量分离蛋白质)
>100糊状不成形,易破碎。;SDS和还原剂的作用:
(1)分子被解聚成组成它们的多肽链
(2)氨基酸侧链与SDS充分结合形成带负电荷的蛋白质-SDS胶束;蛋白质-SDS胶束所带的负电荷达到超过了蛋白质分子原有的电荷量,消除了不同分子之间原有的电荷差异。;蛋白质-SDS胶束的特点:
(1)形状像一个长椭圆棒
(2)短轴对不同的蛋白质亚基-SDS胶束基本上是相同的
(3)长轴的长度则与亚基分子量的大小成正比。
胶束在SDS系统中的电泳迁移率主要取决于椭圆棒的长轴长度,即蛋白质或亚基分子量的大小。;围选择适宜的分离胶
蛋白质-SDS胶束的特点:
1967年由Shapiro建立。
制胶缓冲液:Tris-HCl
PAGE孔径的大小主要由Acr和Bis这两种单体的浓度决定。
(1)溶液中SDS单体的浓度
大小形状不同所致)
SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳
当T固定时,Bis浓度在5%时??径最小。
糖蛋白)以及一些结构蛋白如胶原蛋白等。
1969年由Weber和Osborn进一步完善。
非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(native)
蛋白质-SDS胶束所带的负电荷达到超过了蛋白质分子原有的电荷量,消除了不同分子之间原有的电荷差异。
PAGE的浓度与孔径的关系
SDS和还原剂的作用:;PAGE的浓度与孔径的关系;;3、分类;电泳体系中所用的缓冲液成分、pH、凝胶浓度相同;不连续SDS
1.原理;①凝胶的不连续性:
浓缩胶:大孔径。样品在其中浓缩,并按迁移率递减的顺序逐渐在其与分离胶的界面上积聚成薄层。
分离胶:小孔径。蛋白质分子在大孔胶中受到的阻力小,移动速度快,进入小孔胶时遇到的阻力大,迁移速度减慢。由于凝胶的不连续性,在大孔胶和小孔胶界面处就会使样品浓缩,取带变窄。;②缓冲离子的不连续性
③pH的不连续性
④电位梯度的不连续性
制胶缓冲液:Tris-HCl
浓缩胶pH6.7分离胶
电泳缓冲液:Tris-甘氨酸
在浓缩胶中,pH环境呈弱酸性,甘氨酸解离少,在电场作用下泳动效率低,而Cl—却很高,两者之间形成导电性较低的区带,蛋白分子介于二者之间泳动。;由于导电性与电场强度成反比,这一区带形成了较高的电压梯度,压着蛋白质分子聚集到一起,浓缩为一狭窄的区带。
样品进入分离胶()后,由于胶中pH的增加,甘氨酸大量解离,泳动速率增加,直接紧随Cl-之后,样品不再受离子界面的影响。;实验过程;实验步骤;试剂名称;2.分离胶的制备
胶灌至距梳子齿下端1cm→灌毕→封上一层水加速
聚合→当胶与水出现清晰界限时表明聚合好。
3.浓缩胶的制备
用滤纸吸干水→倒入
浓缩胶→插入梳子→静置,聚合。
;二、样品处理与加样
1.样品处理
2.加样
小心拔出梳子上下槽
注入电极缓冲液用
微量进样器点样
三、电泳
接上电泳仪,上槽为负极,下槽为正极。打开
开关,保持恒压进行电泳。;电泳过程中分子迁移的规律,小分子走在前头,大分子滞后。电泳凝胶相当于凝胶过滤中的一个带孔胶粒。;流程图;结果分析;2.标准曲线的绘制;3.未知蛋白质样品分子量的测算
;在一定的凝胶浓度下,多肽链分子量的对数与多肽链的相对迁移率成线
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