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实验一 酵母RNA的提取及含量测定
一、实验目的与要求
1、了解并掌握稀碱法提取RNA的原理和方法。
2、熟悉和掌握紫外吸收法测定核酸含量原理和操作方法,
3、熟悉紫外分光光度计的基本原理和使用方法。
二、实验原理
由于RNA的来源和种类很多,因而提取制备方法也很各异。一般有苯酚法、去污剂法和盐酸胍法。其中苯酚法又是实验是最常用的。组织匀浆用苯酚处理并离心后,RNA即溶于上层被酚饱和的水相中,DNA和蛋白质则留在酚层中。向水层加入乙醇后,RNA即以白色絮状沉淀析出,此法能较好的除去DNA和蛋白质。上述方法提取的RNA具有生物活性。工业上常用稀碱法和浓盐法提取RNA,用这两种方法所提取的核酸均为变性的RNA,主要用作制备核苷酸的原料,其工艺比较简单。浓盐法使用10%左右氯化钠溶液,90℃提取3-4h,迅速冷却,提取液经离心后, 上清液用乙醇沉淀RNA。稀碱法使用稀碱使酵母细胞裂解,然后用酸中和,除去蛋白质和菌体后的上清液用乙醇沉淀RNA或调pH2.5利用等电点沉淀。 酵母含RNA达2.67-10.0%,而DNA含量仅为0.03-0.516%,为此,提取RNA多以酵母为原料。核酸、核苷酸及其衍生物的分子结构中的嘌呤、嘧啶碱基具有共轭双健系统(-C=C一C=C-),能够强烈吸收250-280nm 波长的紫外光。核酸(DNA,RNA)的最大紫外吸收值在260nm 处。遵照Lambert-Beer 定律,可以从紫外光吸收值的变化来测定核酸物质的含量。
在不同pH 溶液中嘌呤、嘧啶碱基互变异构的情况不同,紫外吸收光也随之表现出明显的差异,它们的摩尔消光系数也随之不同。所以,在测定核酸物质时均应在固定的pH溶液中进行。
核酸的摩尔消光系数(或吸收系数),通常以ε(ρ)来表示,即每升含有一摩尔核酸磷的溶液在260nm 波长处的消光值(即光密度,或称为光吸收)。核酸的摩尔消光系数不是一个常数,而是依赖于材料的前处理、溶液的pH 和离子
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强度发生变化。RNA 溶液(pH = 7.0)的ε(ρ)= 7 700-7 800,RNA 的含磷量为9.5%,含1μg /mL RNA 溶液的光密度为0.022-0.024。因此,测定未知浓度的DNA(RNA)溶液的光密度OD260nm,即可计算测出其中核酸的含量。该法简单、快速、灵敏度高,如核酸3μg/mL 的含量即可测出。对于含有微量蛋白质和核苷酸等吸收紫外光物质的核酸样品,测定误差较小。
蛋白质由于含有芳香族氨基酸,因此也能吸收紫外光。通常蛋白质的吸收高峰在280nm 波长处,在260nm 波长处的吸收值仅为核酸的十分之一或更低,故核酸样品中的蛋白质含量较低时对核酸的紫外测定影响不大。
三、主要仪器和试剂
试剂:啤酒酵母粉、0.04M NaOH溶液、95%乙醇、乙醚、酸性乙醇溶液:30mL乙醇加0.3mL HCl。
仪器:紫外分光光度计、离心机、真空干燥箱、三角瓶、烧杯、水浴锅。
四、实验步骤
1、称取5g干酵母粉,用30mL 0.04M NaOH溶液分步在研钵中研磨均匀后,转入2支50ml比色管,沸水浴加热35min,冷却,转入离心管,4000r/min,离心15min,将上清慢慢倾入装有10mL酸性乙醇的离心管,边加边搅动。
2、加毕,静置,待RNA沉淀完全后,5000r/min离心5min。弃去上清液。用95%乙醇分步将沉淀转移至布氏漏斗抽滤并洗涤,消耗95%乙醇体积总约30ml;
3、再用乙醚洗涤沉淀两次,消耗体积总约20ml,沉淀在空气中干燥。称量所得RNA粗品的重量(减去滤纸重量),并记录该数据。
4、RNA粗品中RNA纯度测定:将样品配制成含5~50μg核酸/mL的溶液:将上述RNA粗品溶解于100ml容量瓶,定容,静置,取上清液于紫外分光光度计上测定260nm吸收值,按下式计算纯品RNA浓度。若O.D260读数过大,则根据O.D260值再做适当稀释。
五、计算:
O.D260-260nm 波长处的光密度读数;
L-为比色杯的厚度,一般为1或0.5;
0.024为1μgRNA/mL的光密度;
结果
RNA浓度=O.D260/0.024×L=0.386/0.024μg/mL=16×10^-6 g/ml
干酵母粉RNA含量=RNA重/干酵母称重×100%
=16×10^-6 g/ml×100ml/5g×100%
=0.032%
七、思考题
1.破酵母细胞时为什么要在沸水浴中进行?
答:由于酵母细
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