一种利用简化基因组测序数据鉴定蚕豆SNP的方法.pdfVIP

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2023-06-01 发布于四川
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一种利用简化基因组测序数据鉴定蚕豆SNP的方法.pdf

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本发明公开了一种利用简化基因组测序数据鉴定蚕豆SNP的方法，包括：步骤一、提取样品基因组DNA；步骤二、构建RAD文库，基因组DNA使用EcoRI酶切，利用PCR扩增法富集文库，采用琼脂糖凝胶回收目的条带，单末端进行测序；步骤三、生成原始序列并进行序列质控分析，根据序列相似性将高质量序列聚类生成RAD‑tags，将RAD‑tags聚类分群进行SNPcalling，矫正SNP基因型；步骤四、KASP标记开发与SNP基因分型。本发明方法利用基因组测序数据挖掘SNP，不仅可以鉴定出基因表达区域的SN

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112553361 A (43)申请公布日 2021.03.26 (21)申请号 202011310367.5 (22)申请日 2020.11.20 (71)申请人浙江省农业科学院地址