基于卷积神经网络预测蛋白和配体分子结合自由能的方法.pdfVIP

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2023-05-24 发布于四川
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基于卷积神经网络预测蛋白和配体分子结合自由能的方法.pdf

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本发明提供一种基于卷积神经网络预测蛋白和配体分子结合自由能的方法，包括以下几个步骤：（1）从PDB数据库，获取高质量的蛋白‑配体复合物晶体结构，以及从文献中收集小分子结构并进行3D构象准备；（2）对蛋白和小分子进行编码和描述符计算，将蛋白处理为3D图像；（3）用蛋白的3D图像作为输入，设计卷积神经网络的架构，包含输入层、隐藏层和输出层；（4）对预训练的模型进行了特征提取和微调，以应用在新数据集上；（5）待所有任务完成后，调用Pandas和Matplotlib数据分析库，直接在jupyter中绘制

(19)中华人民共和国国家知识产权局 (12)发明专利申请 (10)申请公布号 CN 112185458 A (43)申请公布日 2021.01.05 (21)申请号 202011147348.5 (22)申请日 2020.10.23 (71)申请人深圳