imagej分析粒径尺寸及分布.pdfVIP

Morphological study: focal contacts formation For quantification of vinculin positive contacts areas, we used the freeware image analysis ImageJ (NIH, /ij/). We opened the raw image, converted it to an 8-bit file, and used the unsharp mask feature (settings 1:0.2) before removing the image background (rolling ball radius 10). After smoothing, the resulting image, which appears similar to the original photomicrograph but with minimal background, was then converted to a binary image by setting a threshold. Threshold values were determined empirically by selecting a setting, which gave the most accurate binary image for a subset of randomly selected photomicrographs with varying peptides densities. The cell area was determined by manual delineation on raw fluorescent images, total contact area and mean contact area per cell were calculated by ‘‘analyseparticules in’’Image J, contacts smaller than 3 pixels were not taken into account. 首先用工具栏里的直线工具，沿 SEM、TEM 的标尺（bar）拉出一条等长的 直线，在菜单栏里找到 measure点击，得到标尺对应的长度数据 （弹出的数据栏）； 接着用同样的步骤测量你的 particles;最后导出你的数据， 放到 excel、origin 里处 理就行了 ~ 测量的值是相对值，要利用 bar 的相对值和实际值进行换算 ~乘下除下就行 了~ 首先要在 measur 里面选择 spatial calibration，将这里面标尺与自己图片里面 的标尺对应，最后选择 measurements，features 里面选择直线。自己在图片里面 画线，用长度除以晶粒数就 ok 了 不知道这个是不是你想要的。可以用 line profile 测量尺寸，但是你要知道 imageJ 是根 据光的强弱来测量的，不一定准，如果你的图片使用 AFM 做的，可以直接用 AFM 的软件 处理会更准确。 最后一张图是 3D 效果。 1.jpg 2.jpg 3.jpg 4.jpg 5.jpg 好几次在论坛里看到有虫友问关于金相图片中如何测量颗粒尺寸以及使用什么图像处 理软件的问题， 作为一个去年刚毕业并有过相关金相图片处理经验的过来人， 决定写下关于 这方面的经验，希望对大家有一定的帮助，在这里我使用的图片处理软件有两个： PHOTOSHOP 和 IMAGE-PRO-PLUS 。现在介绍如下： 1，首先我们用 PHOTOSHOP 把金相图片中需要测量的颗粒尽可能的用魔棒工具选择出来然 后 进 行 反