生物样本库岗前培训-信息化管理体系.pptx

1提纲? 生物样本用于医学转化研究的流程? 信息化体系中涉及的实体、数据和联系? 信息化体系的核心目标和实现手段? 信息化实践中遇到的矛盾和问题2生物样本库≈生物信息库基因突变、蛋白表达、表观修饰、等等生物样本（潜在信息）患者信息3Lifecycle 运转流程Content操作对象患者信息软件开发取样硬件人样本Infrastructure基础架构储存利用4样本流患者样本储存手术器械冰冻切片机等病理设备生物分子新鲜组织配套设备核酸提取仪组织研磨仪分光光度计其他设备液氮罐超低温冰箱条码打印机扫描仪冻存组织5信息流姓名、性别、年龄、民族、联系方式临床诊断、发病日期、发病部位、家族史、症状、体征、实验室检查、内窥镜检查、影像学检查、治疗情况患者大体形态、肿瘤最大径、切缘情况、浸润范围、转移部位、检出淋巴结个数、阳性淋巴结个数、TNM分期来源样本、浓度、质量检测和研究结果（如基因突变、蛋白表达、表达谱等｝样本管理样本储存生物分子新鲜组织配套设备病案随访随访状态随访结局末次随访时间复发转移情况冻存组织存放位置、冻存时间、重量或大小、处理方法、保存条件、条码编号、分管信息低温维持、冻融情况6人员流临床科室临床医生患者样本管理样本储存临床科室研究中心研究人员生物分子新鲜组织配套设备病案随访病理科病理医生冻存组织样本库随访人员样本库技术员7保障系统样本库管理员数据备份FTP服务器数据库服务器患者样本管理样本储存生物分子新鲜组织配套设备病案随访温控探头短信发射器主控服务器冻存组织低温监控样本库技术员低温维持、冻融情况8样本库管理员姓名、性别、年龄、民族、联系方式临床科室临床医生数据备份临床诊断、发病日期、发病部位、家族史、症状、体征、实验室检查、内窥镜检查、影像学检查、治疗情况FTP服务器数据库服务器患者大体形态、肿瘤最大径、切缘情况、浸润范围、转移部位、检出淋巴结个数、阳性淋巴结个数、TNM分期来源样本、浓度、质量检测和研究结果（如基因突变、蛋白表达、表达谱等｝样本管理样本储存临床科室研究中心研究人员手术器械冰冻切片机等病理设备生物分子新鲜组织配套设备病案随访病理科病理医生核酸提取仪组织研磨仪分光光度计其他设备随访状态随访结局末次随访时间复发转移情况液氮罐超低温冰箱条码打印机扫描仪温控探头短信发射器主控服务器冻存组织样本库随访人员存放位置、冻存时间、重量或大小、处理方法、保存条件、条码编号、分管信息低温监控样本库技术员低温维持、冻融情况9用户视角临床科室研究中心研究人员样本? 组织实物 ? 血清样本? 病理资料信息 ? 随访资料查询? 检索系统手段 ? 条码标签10技术员视角冰箱、液氮罐样品盒样本库技术员条码打印机、扫描仪患者和样品信息录入冰箱温度样本库随访人员随访信息更新11管理员视角样本库管理员样本库规划者样本库样本查询录入客户端条码打印客户端温度监控客户端交互界面管理系统操作系统样品盒定位架冰箱样本管理/条码打印系统样本管理系统温度监控系统操作系统操作系统操作系统服务器、信号接收器、短信发射器房间（电气、网络、温度、湿度、承重）底层硬件服务器配置条码打印机12提纲? 生物样本用于医学转化研究的流程? 信息化体系中涉及的实体、数据和联系? 信息化体系的核心目标和实现手段? 信息化实践中遇到的矛盾和问题13涉及的实体、数据和联系? 以信息化的形式呈现样本库中的实体，实体关联的数据，实体与实体之间的联系，数据和数据之间的联系。? 为用户（临床研究工作者）提供合用的生物样本和数据，验证临床问题和科学假设。14信息化体系中的实体和数据? 标本? 患者（标本来源）? 操作者? 储存空间? 仪器/设备? 检测/研究结果? ……15数据的储存形式16实体和数据之间的对应关系? 标签? 唯一号17数据之间的逻辑关系以肿瘤患者为例1. 出生日期2. 确诊日期3. 手术前放化疗日期4. 手术治疗日期5. 手术后放化疗日期6. 进展日期（复发，转移）7. 死亡日期8. 末次随访日期18如何规划信息化管理体系? 保存那些信息？? 在何时、何地、何节点，由何人保存？? 保存为何种形式？保存于何种介质？? 信息是否对应于某个实体？是否唯一对应？? 信息是否会更新？何人有更新权限？更新过程如何记录？? 信息如何备份？如何校验？? 是否由更原始的数据加工产生？加工标准为何？会否变动？? 信息的呈现形式是否合乎常理？会否导致误解？19信息化规划的简单流程? 以保存一份血清和相关信息为例1、系统管理员规划待保存的信息虚拟冰箱/液氮罐设置冰箱通过自定义层，架，列，样品盒等的空间位置，可完全模拟任何品牌冰箱/冰柜/液氮罐的真实储存空间。自定义样品盒类型自定义字段功能样品及样品源信息管理字段类型样品源字段管理样品字段管理自定义样品信息样品及样品源所有相关详细信息，用户自己都可以通过