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绿盲蝽气味结合蛋白OBP-7的功 能鉴定 Identification of stucture of odorant binding protein7 in Apolygus lucorum 第八组报告人：朱晓强 组员：朱晓强陈金奕王金鑫张重阳 植物保护研究所 内容概括 • 1. 研究目的 • 2. 序列获得 • 3. AlucOBP7的序列分析 • 4. 序列比对和系统进化树的构建 • 5. AlucOBP7的三维结构 • 6. 总结 1.研究目的 • OBP(odorant binding protein)：气味结合 蛋白 • PBP(pheromone binding protein)：性信息 素结合蛋白 2.序列获得 • EST：基因表达序列标签(Expressed Sequences Tags, ESTs)，一般是从cDNA文库中随机挑选单克 隆进行测序得到的序列片段，序列长度一般为60 bp-500 bp 。与全基因组测序相比，EST序列具有 快速、简便、成本低的优势。 • 1993年NCBI专门建立了EST数据dbEST(database of EST)，系统的收集和保存所有的EST数据。在 dbEST 中记录了每个EST的序列号、测序引物、碱 基序列、cDNA文库构建方法、组织来源等详细资 料。由于EST来源于生物体不同组织或同一组织的 不同发育阶段的cDNA文库，因此通过对这些EST 数据进行比较可以发现组织间或同一组织不同发育 阶段特异转录表达的基因。 AlucOBP-7的ORF ATGAACCCACTCATTCTCATACTGTTGGTAGTATTTGC TGCTGCGACGAGGGGAGAAGAACAAGCCAACGCCT TGGTAGCCAAAGCTTTCAACAAATGCTTTGGAGAATT TCCTCTCGGGGACGATGAAATGAAAGAAGTGAAGGA TAAATCGACTGTCCCAAGCTCACATAATGCCAAATGC CTCATGGCGTGCATGTTGAAAGAAGGGAGAATTTTG AGGGGTGGGAAGTACGAGTTAGAGAATGCAATTTTG ATGGCTGACGTACTCAACAAAAATGATCATGCAGCAA CCGACAAGGCGAAGCAGTTGATCGAAACGTGTGCT GCCCAAGTGGGTACTGACGCCAGCGCAGACGAGTG CGAATTCGCCTACAAAATGGCTCTTTGTGCCTCAGAT GAAGCTAAGAAGCTTGGAGTTCGTCCGCCAGATTTC TGA 3.AlucOBP7的序列分析 (1).用WebLab 的transseq将CDS翻译成氨基酸 序列 (2).用WebLab 的tmap预测跨膜螺旋 (3).用ExPASy 的ProtScale预测疏水性 (4).用CBS 的TargetP进行亚细胞定位 (5).用WebLab 的sigcleave预测信号肽 (6).用WebLab 的garnier预测二级结构 (7).用SMART预测结构域 4.序列比对和系统进化树的构建 • AlucOBP-4 • MEVAACLVLLAALAALTAAVEEGRPLCKAPTTAPRKLEKVINQCQEEIKYALLQEAPSV LGETVGLKTALTRNRSKRETFTGEERRIAGCLLQCVYRKMKALDETGFPTATGLVKIY SEGVEDRNYYLATIQGVQRCLSRELQSRNTNPSIVKAEGYSCDVAYDMFNCVSEQIE QLCGTSP • AlucOBP-5 • MNSIIVLCLVASAVTLSQGNPTTPNPSTSHVSSSAGITVSGVSKSPEEIKLKIKEQVAT