lammps语法规则及常用任务.doc

Lammps 语法 输入脚本中的每个非空行被当作一个命令。LAMMPS 命令是区分大小写的。 命令名是小写的,如指定命令参数。大写字母可能用于文件名或用户选择的 ID 字 符串。 下面是 LAMMPS 每一行的输入脚本解析： （1） 如果某行的最后一个可打印字符是“＆”字符，则假定该命令在下一行 继续。通过删除“＆”字符和换行符，下一行将连接到上一行。这使长命令延续在 两条或更多条的命令上。请参阅（6），如何在不使用“＆”字符的情况下在多行上 继续执行命令。 (2) “＃”字符后的所有字符都被视为注释并被丢弃，详见（6）。注意，“＆”字 符后面的注释将阻止命令在下一行继续。另外请注意，对于多行命令，单个 “＃” 字符将注释整个命令。 （3）某行重复有哪些信誉好的足球投注网站“$”字符，表示用文本字符串替换该变量，详见（6）。 如果字符“$”后跟大括号，则变量名称是大括号内的文本。如果字符“$”后没 有大括号跟随，则变量名称是紧跟在$之后的单个字符。如${myTemp} 和 $x 的 变量名分别为 myTemp and x。 变量如何转换为文本字符串取决于变量的样式。它可以是一个存储多个文本 字符串的变量，并返回其中的一个。返回的文本字符串可以是多个“单词”（空格 分隔），然后将其解释为输入命令中的多个参数。该变量还可以存储为一个数学 公式，该公式将被估算，其数值结果作为字符串返回。 如果字符$后跟圆括号则是一种特殊情况，圆括号内的文本被视为“临时”变 量，并被评估为等式样式的变量。这是在输入脚本中使用数字公式的方法，而不 必给它们分配变量名称。 variable X equal (xlo+xhi)/2+sqrt(v_area) region 1 block $X 2 INF INF EDGE EDGE variable X delete 等价于： region 1 block $((xlo+xhi)/2+sqrt(v_area)) 2 INF INF EDGE EDGE 以便您不必定义（或丢弃）临时变量 X. 注意，变量的大括号或即时形式都不能包含嵌套的$字符以供其他变量替代。 如下做法是错误的： variable a equal 2 variable b2 equal 4 print B2 = ${b$a} 不能为一个临时变量指定$（$ x-1.0），但可以使用$（v_x-1.0），因为后者是 符合等效样式变量语法。 有关字符串如何分配给变量和评估的详细信息，以及如何在输入脚本命令中 使用，请参阅变量命令。 （4）某行“单词”被空格分隔（制表符，空格）隔开。 请注意，单词可以包 含字母，数字，下划线或标点符号。 （5）每行的第一个词是命令名。 行中的所有连续词都是参数。 （6）如果要将具有空格的文本视为单个参数，则可以将其包含在单引号或 双引号或三引号中。如果使用“＆”字符，则单引号或双引号的单个参数可以跨多 个行。当行连接在一起（并删除“＆”字符和换行符）时，文本将变为单行。如果 希望多行参数保留换行符，则文本可以用三重引号括起来，在这种情况下不需要 “＆”字符。例如： print Volume = $v print Volume = $v if ${steps} 1000 then quit variable a string red green blue purple orange cyan print System volume = $v System temperature = $t 在每种情况下，单个，双引号或三引号在其内部存储的单个参数被删除。 引号之间的“＃”或“$”字符不会被视为（2）中的注释指示符，或在（3）中替 换为变量。 注意：如果参数本身是一个需要引用参数的命令（例如，使用 print 命令作 为 if 或 run 命令的一部分），则单引号，双引号或三引号可以以通常的方式 嵌套。 Lammps 常见任务介绍 本节介绍如何使用 LAMMPS 执行常见任务。 1. 重启模拟 通常有 3 种方法可以继续 LAMMPS 模拟。多个运行命令可以在同一个输入 脚本中使用，每次运行将从上次离开时的运行位置开始。或者使用 restart 命令将 二进制重启文件保存到磁盘。稍后，这些二进制文件可以通过新脚本中的 read_restart 命令读取。或者可以使用-r 命令行切换将其转换为文本数据文件，并 在新脚本中通过 read_data 命令读取。 下面，给出读取二进制重新启动文件或转换后的数据文件的 2 个脚本的示 例，然后发出一个新的运行命令以继续上次离开时的运行位置。示例说明了在新 脚本中必须做出的设置。详细信息在read_restart和read_data命令的文档中讨论。 如果脚本有如下一行： restart 50 tm