水稻籼稻）基因组工作框架图与精细图的绘制！.pdfVIP

２００３牗１牘 院 刊 ２９ 成果与应用 水稻籼稻基因组 工作框架图与精细图的绘制 中国科学院基因组生物信息学研究中心暨北京华大基因研究中心 北京 摘要 年 月 日，中国科学院、国家科技部、国家计划委员会、国家自然科学基金委员会 联合宣布“中国水稻（籼稻）基因组精细图完成”。 此前，我国科学家于 年 月完成了其工 作框架图的绘制。水稻 籼稻 基因组工作框架图与精细图是继人类基因组计划之后所测定完成的 最大的植物基因组，也是迄今为止惟一用“霰弹法”完成的最大基因组精细图。这表明中国在基因 组科学领域处于世界领先地位；也标志着中国的高性能计算在生物信息领域的综合实力。文章概 要地介绍了该项成果的研究背景和意义、主要内容、研制过程和方法、应用价值及国内外的评价。 关 键 词 水稻基因组，工作框架图，精细图 研究背景与意义 植面积占世界稻谷生产的 以上。中国是世界上 水稻是世界上最重要的粮食作物，全球近半数 水稻种植面积最大的国家之一，袁隆平院士培育的 人口以其为生。水稻基因组是迄今为止开展基因组 超级杂交水稻较其它品种增产— ，为解决 测序的最大植物基因组，约为人类基因组的 ，约 我国及世界的粮食问题做出了重大贡献。为开发这 亿对碱基。通过对水稻全基因组序列分析，可以 一宝贵的国家资源，为继续保持我国在杂交水稻育 获得大量的水稻遗传信息，全面了解其遗传机理， 种领域的国际领先地位，由中国科学院基因组生物 信息学研究中心暨北京华大基因研究中心（ ）发 并可获得大量用于农作物改良的极具价值的基因。 由于水稻是禾本科作物中的模式生物，对其遗 起，遗传与发育生物学研究所和国家杂交水稻工程 传密码的破译，将促进玉米、小麦等其它重要农作 技术研究中心等共同参与的“中国杂交水稻基因组 计划”于 年 月 日正式启动，选取超级杂 物的研究和应用发展，从而带动整个粮食作物的研 究。因其所蕴含的巨大社会效益和经济效益，国际 交稻的父本———纯种籼稻 为研究对象。 上对水稻基因组研究的竞争非常激烈。日本于 研制过程及主要内容 年将水稻基因组制图计划列入水稻基因组研究规 “工作框架图”是指覆盖基因组的大于序 划。 年 月，由日本科学家牵头的“国际水稻基 列的基因图谱，但仍存在碱基、序列不确定的区域 因组计划”（ ）正式启动，选取日本主要栽培品 和未在染色体上定位的序列。“精细图”则是指基因 种———粳稻 “日本晴”为研究材料。随后，美国 组中所有基因覆盖区域碱基序列精确、基因精确定 公司和瑞士 公司相继开展了对 位于染色体上的基因图谱。目前，国际通用的测序 “日本晴”的基因组