家鹅细胞色素b基因序列进化及系统发育关系研究-动物遗传育种与繁殖专业论文.docx

摘要本实验溯定了中国家鹅15个品穆、欧溯鹅2令菇耱共艟令个体静绥耱色素b基 摘要 本实验溯定了中国家鹅15个品穆、欧溯鹅2令菇耱共艟令个体静绥耱色素b基 因全序列，-q Genbank库中自额雁细胞色素b基因序列合并在一超比对分析，17个 家鹅品种和自额雁细胞色索b基因全序列均为1 143bp，序列中没有缺失、插入溅移 弼突交(fi礤ncshiflmutation)，共检铡鬟29令交舅徒杰、4静萃薅鍪，孩蔷酸多样发 和单倍型多样度分别为0．00648和0．45。碱基含量分析可知，序列的G+C含量 (49．3％)A+T含量(50．7％)，密码乎第三位点的G、T含量都有较强的偏倚性； 磐翻润G—A秘蕈一c夔转羧数(22次秘15次)裹予A—G霸c一{瓣转换数t0 次和9次)，c—A、T—G籁换数均为2次，其余颠换模式均未发嫩；转换数(秘) 明显高于颠抉数(Tv)，Ts／Tv=9．5～19，密码子第三位点的转换数最高，呈现了相当 强爨瓣转换镛僚性；密弱予燕一、二秘三链熹鹣gamma努纛参数a蓬努嗣为 0．00572、O．01237和1．05239，表明密码予第一位点的替换速率变异最大，第二位点 次之，第三能点的替换速率变异相对较小{编码同一氨基酸的同义密码子并非随机 使用，表瑷波一定程度豹链瘸镶篱性；阏义替换速搴(ds)移菲弱义鸷换速率(dN) 分别为0．0787和0．0011，dS岛dN值间的麓异极显著(z=4．713，pO．01)，而(．)(dS／dN) =o．0284，明驻小于0．3，浚明雁属鹅细胞色素b基因序列经历了中度净化选择作用： 擎¨步菲嚣义蘩抉(Sing-step nonsymonymous codon substitution，SSNCS)分毒羧式与 Grantharm’鼹离之间的关系说明密码予的三个位点所受的净化选择强度不同；构建的 最大简约树与邻接树拓扑结构一致，支持中国家鹅的双起源学说，即除伊犁鹅外的 其它孛国鹅藏萼I}起源于鸿壤，擎犁鹅_帮敬2}l|戆罄德鹅、莱蓑鹅起源予灰藤。 荧键词：家鹅鸿雁灰雁白额雁细胞色素b分子进化系统发育 1前言线粒薅DNA(mitochondrial 1前言 线粒薅DNA(mitochondrial DNA，mtDNA)瓤faI潋聚舍酶链式及应(PCR)必基 础的DNA测序技术的联合使用，促进了mtDNA在动物起源、分类、种群分化与系统 发育等方面的研究，并取得了重要进展，．为研究家养动物的分子进化、系统发育关系 秘群钵遗抟结{奄等挺珙了毅豹摄会。线毅髂DNA纲藏惫素b(cytochrome b)基瓣垂 于其序列测定容易进行、含有高分辨率的系统发育信息及在生物类群中存在范围极广 簿特点而被认为足探讨近缘物种间遗传分化的良好标记，对系统进化和分类研究宵较 强熬遥爝性(Irwin等，1991)，已在多秘旗物类群豹分子进纯霹系绞发育研究中褥到 了有效应用(Smith等，1991；Ouinn和Wilson，1993；Ruokonen，2000)。因藏，通 过mIDNA细胞色素b基因序列的测定，对于解决有关家鹅分子进化和系统发育研究 串熬诲多有争论戆阏题，了孵家鹅豹起源秘瑟种分化、晶季孛资源状况及鹅豹遗蕊肖静 等其有重要斡参考价值。 1．1线粒体DNA 1．1。1动物线粒体DNA瓣结构组成 线粒俸蹩存在于绝大多数真核缓臆雨虢一种基本的、重要的鲡稔器，它是绸臌氧 化磷酸化的场所。线粒体本身遗传物质一线粒体基因组(mtDNA)的发现(Nass，1965)， 为细胞遗传倍惑系统的研究揭开了掰的一页，人们把这一遗传信息系统归于真核缁胞 驹第二遮传售憨系统，或核终基因及冀表遮系统。 动物线粒体DNA(mitochondrial DNA，mONA)为～个长度为15～20kb的环状分 予，由重链(H)和轻链(L)组成。多数动物mtDNA均由37个旗因和一段长度可 交瓣菲编码痔列缀成。在线粒俸萋因绦串主要存在辩羧菲编码酝，一段楚控翻区 (control re舀on)，另一段怒L-链复制起始区。控制区又称D．环区(displacement-loop region)，位于tRNA-Pro和tRNA-Phe基因之间，是整个线粒体基因缎序列和长度变异 袋大静嚣域，毽英孛氆惫会蠢绦守冀毅。蘩嚣编璐彦确翔编码羞2静rRNA、22耱tRNA 和13个疏水鬣臼质多肽，遮些多肽包括了与线粒体内膜相结合的酶复合体的亚单位： 细胞色素b(Cyt b)、2个ATP酶的亚单位、3个细胞色紫c(Cyt-c)氧化酶的亚单位(COI ，COll、cOlll)、7令NADH还藩藩复合髂豹亚萃霞(№。l、ND--2、套lDL3、ND-4、 ND-4L、ND-5和ND 6)。除一个蛋白质熬因(ND6)和8个tRNA蒸因由L．链编码外