《基于COI基因序列对烟台与辽宁仿刺参种群的遗传结构差异的探寻》-毕业论文（设计）.docVIP

PAGE 1 学 士 学 位 论 文 基于COI基因序列对烟台与辽宁仿刺参种群的遗传结构差异的探寻 姓名 院系 生命科学学院 专业 生物科学 年级 2009级 学号 20092513464 指导教师 讲师 2013年5月28日 毕业论文开题报告 姓名 性别 女 学院 生命科学学院 年级 2009级 学号 20091513464 题 目 基于COI基因序列对烟台与辽宁仿刺参种群的遗传结构差异的探寻 课题来源 教师推荐 课题类别 基础研究 选题意义（包括科学意义和应用前景，研究概况，水平和发展趋势，列出主要参考文献目录）： 刺参 Stichopus (Apostichopus) japonicus 主要分布在日本、中国、韩国以及俄罗斯远东地区，在中国主要分布在辽宁、山东、河北等北方沿海，是我国最重要的经济种类，不仅营养价值最高，而且药用价值广泛。在过去的 20 年中，刺参养殖业在我国广泛的开展起来。在 2005 年产量已经达到 65283 吨，养殖面积达到 73987 ha (DOF 2006)。近些年来，刺参需求量的不断增加推动了海参捕捞业和养殖业的迅速发展，同时也不可避免的造成了刺参自然资源的枯竭和养殖种类种质质量的退化。为了尽快掌握刺参的种质资源状况，满足遗传资源管理和育种研究的需要，急需对刺参的遗传背景进行深入的了解。 参考文献： [1]李颖，刘萍，孙慧玲，等. 仿刺参（Apostichopus japonicus）mtDNA 三个基因片段 的序列分析[J].海洋与湖沼，2006，37(2)：143–153. [2] 王鹭骁，柯才焕，王志勇，等. 中国沿岸几种鲍线粒体16S rRNA基因片段序列比较 及鲍属系统发育[J]. 中国水产科学，2006，13(2)：167–173. [3] 闫晗. 利用 ISSR 和 COI 序列标记分析不同地理仿刺参群体的遗传多样性[D]：[硕 士学位论文].辽宁：辽宁师范大学，2003. 研究主要内容和预期结果（说明具体研究内容和拟解决的关键问题，预期结果和形式，如在理论上解决哪些问题及其价值，或应用的可能性及效果）： 长期以来，海参纲的分类是基于形态学上的特征，例如内呼吸树的有无，触手的形态以及疣足的有无和分布。属间的分类要根据更为细微的一系列特征，如体壁骨片的形态，食管石灰环的形态，管足的分布和形态。不同地理种群间的形态差别就更加细微，分类更加模糊。目前为止，尽管对刺参有很多形态学上的研究，但对于不同地理种群基于分子水平的研究还不多。线粒体 DNA 由于具有分子量小、结构简单、进化速度快等特点，已成为动物群体遗传学和系统进化研究的重要对象。近年来已经越来越多的应用在水生动物的遗传学研究上。本实验是利用刺参线粒体COI基因片段对分别采自烟台和辽宁的仿刺参进行遗传结构的分析，其目的在于了解分布在不同地理位置的刺参的 DNA 变异水平，找到烟台与辽宁海参遗传结构上的区别。 拟采取的研究方法和技术路线（包括理论分析、计算，实验方法和步骤及其可行性论证，可能遇到的问题和解决方法，以及研究的进度与计划）： 研究路线：第一阶段：查阅资料，寻找、设计合理的试验方案，准备开题； 第二阶段：了解提取DNA和PCR扩增的流程； 第三阶段：进行试验，记录数据； 第四阶段：整理资料、撰写论文初稿和修改论文。 第五阶段：论文定稿、毕业论文答辩。 可能遇到的问题：目的基因片段扩增不出；COI基因变异不明显。 解决办法：优化PCR反应；增加取样的范围和数量。 研究计划：利用COI基因片段对分别采自烟台和辽宁的仿刺参进行遗传结构的分析，了解分布在不同地理位置的刺参的 DNA 变异水平，找到烟台与辽宁海参遗传结构上的区别。 指导教师意见（对论文选题的意义、应用性、可行性、进度与计划等内容进行评价，填写审核结果：同意开题、修改后再开题、不同意开题）： 由于海参具有极高的营养价值和药用价值，已经成为中国、日本等国家的重要经济养殖种类。近些年来，刺参需求量的不断增加推动了海参捕捞业和养殖业的迅速发展，同时也不可避免的造成了刺参自然资源的枯竭和养殖种类的种质质量的退化。为了尽快掌握刺参的种质资源状况，满足遗传资源管理和育种研究的需要，急需对刺参的遗传背景进行深入的了解。同学学习基础扎实，实验技能较强，有能力进行海参遗传方面的研究。 该同学在实验前查阅了大量有关海参遗传方面的资料，在此基础上提出了较为合理可行的论文实施方案，并在实验过程中灵活地对方案进行了修改，从实验方案来看，该生掌握了该试验的基础知识与一定的实验技术，具备了实施毕业论文的基本条件。 同意开题。 签名：