巴西橡胶树单染色体分离及其高通量测序分析的研究.pptVIP

煤炭及含硫模型化合物生物降解转化的研究 报告主要内容 课题来源 立题依据 国内外研究进展 本研究的目的和意义 研究内容 研究方法和技术路线 预期目标 新颖之处 所需解决的主要问题 研究基础和条件 研究进度及经费预算 选题背景 最近几年，由于煤炭的降解机理与降解酶有着直接的关系，所以煤炭的生物降解研究主要集中在白腐菌所产生的一系列降解酶，由此也联想到通过提高酶活性和产酶量来达到高降解转化率的目的。一般来说，MnP氧化大部分酚类、胺类等底物，LiP与其互为补充，氧化相对应的物质，而漆酶不仅可以氧化胺类物质也可氧化酚类物质 [9,10]。微生物降解煤中有机硫研究已经取得很大的进展[11-12]，其中研究最多的属嗜硫菌对模型化合物DBT的降解，并且其确定了4S途径的降解机理[13]，对于其他含硫模型化合的研究较少，因此本课题研究了DBTO2的脱硫情况。 1.课题来源 基于基因工程构建煤炭降解工程菌降解转化煤炭的机理研究 生物酶脱除煤炭中有机硫的机理研究（ 2.立题依据 橡胶是我国重要的战略物资。国内外已从橡胶中克隆了近420种基因或cDNA，然而这些基因基本均是从橡胶树cDNA文库或其总基因组中获得，无法确定其在橡胶树染色体上的位置和分布特点，从而导致无法进一步确定其所在的连锁群。研究者也先后发表了利用各种分子标记构建的橡胶树连锁遗传图，但均是从总基因组中获得，并存在着不同程度的连锁群不稳定，丰度小而且分布不均匀，许多功能基因在染色体组上的连锁关系和位置都不清楚，直接利用分子标记辅助橡胶树育种难度较大。 3.国内外研究进展 目前木质素降解酶已成为国内研究的热点，石开仪等人发现白腐真菌通过Lac和Lip的催化作用可以使百里酚脱酚基、脱甲基、开环、氧化等。何宝燕、尹华、彭辉等人研究了黄孢原毛平革菌(Phanerochaete chrysosporium)对十溴联苯醚(BDE209)的降解；发现在含1mg/LBDE209的降解体系中，生物量为1.74g降解率达到最大(86.76%)；卢永等利用黄抱原毛平革菌对焦化废水进行降解研究，找到了降解的最优条件[19]；曾斌等研究了白腐真菌对五氯酚的降解情况 [20]；这些都为进一步探索微生物对有机物的降解打下了基础。 研究内容 （1）紫外诱变对黄孢原毛平革菌酶活性的影响以及酶活性与降解率之间的关系。 （2）微波诱变后的诱变菌的酶活性变化以及对低阶煤的降解状况。 （3）紫外，微波处理的球红假单胞菌对DBT的降解状况及最适诱变时间。 （4）利用响应面处理的方法探索影响DBT降解效果的因素。 （5）球红假单胞菌对其他含硫模型化合物的降解。 创新点 （1）目前，对于利用紫外、微波诱变方法，筛选诱变菌种已做了大量的研究工作，但是这两种处理方法对降解酶系的活性和产量有无影响，以及降解酶活性与降解转化率之间的关系还有待于进一步探索。 （2）球红菌可以降解转化DBT已被我们所熟知，但是紫外或是微波处理后的菌种对其降解效果还未被探究。 （3）球红菌对其他的含硫模型化合有无降解能力，降解效果如何，降解产物具体是那些等问题还未被探究。 （4）首次利用响应面的方法探索了球红菌降解DBT的影响因素的最佳组合 （5）结合生物酶提纯技术，首次探索了紫外，微波诱变处理后降解酶的浓度变化与酶活性变化。. 已发表的采用高通量测序的植物全基因组 De nove 测序: 黄瓜(Cucumis sativus)（Huang S等,2009） 苹果(MalusdomesticaBorkh)(Velasco R等,2010) 野生大豆(Glycine soja)(Kim M Y等,2010) 森林草莓（Shulaev V等,2011)、 可可树(Argout X等,2011) 麻风树(Jatropha curcas)(Sato S等,2011) 枣椰树(Phoenix dactylifera)(Al-Dous E K等,2011)马铃薯(Solanum tuberosum)(Xu X等,2011) 白菜(Brassica rapa)(Wang X等,2011) 大麻(Cannabis sativa)(van Bakel H等,2011) 木豆(Cajanus cajan)(Varshney R K等,,2012) 蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)(Young N 等,2011) 橡胶树的全基因组 De nove 测序目前还为发布。在植物方面对植物单条染色体进行高通量测序仅在小麦的单条染色体臂（聂小军等,