《生物信息学)蛋白质分析和 与蛋白质组学.pptVIP

;5′···GCAGTACATGTC ···3′;human;20世纪生命科学的辉煌成就 1953年,Watson Crick提出DNA双螺旋结构 1957年，“中心法则”的问世 20世纪90年代，人类基因组计划（HGP）;基因组计划的局限 基因不是同时表达 哪些基因，何种条件，如何表达 基因与蛋白的线性关系仅在新生肽中 蛋白的化学修饰与剪切加工改变其立体结构和功能;后基因组时代 　 功能基因组学成为研究重心 　 ;第一节 蛋白质组学的概念及其发展史;什么是蛋白质组？;蛋白质组学(proteomics);主要研究内容 ;什么是功能蛋白质组学？(functional proteomics) ;功能蛋白质组学（Functional proteomics） 功能蛋白质组学能够在细胞和生命有机体的整体水平上阐明生命现象的本质和活动规律。 功能蛋白质组学的研究可为食品改造、疫苗开发和生物制药等提供重要依据。 功能蛋白质组学已成为后基因组的重要组成部分。 ;蛋白质组学应用举例;进 展（国际）;The HUPO World…;1. Human Liver Proteome Project(HLPP) 2. Human Brain Proteome Project(HBPP) 3. Proteomic Standards Initiative(PSI) 4. Human Antibody Initiative(HAI) 5. Plasma proteome Project(PPP) 6. Mouse Models Human Disease(MMHD) 7. Human Disease Glycomics/Proteome Initiative (HGPI) 8. HUPO Cardiovascular Initiative(HUPO CVI);进 展（国内）;科技部已将疾病蛋白质组研究列入我国“973”计划项目和“863”计划项目；国家自然科学基金委员会也将“蛋白质组研究”列为重点项目。 我国在鼻咽癌、白血病、肝癌和肺癌蛋白质组研究方面取得了较大的进展;练习一 熟悉蛋白质有哪些信誉好的足球投注网站数据库;练习二 熟悉蛋白质结构分析软件;;一、蛋白质组表达模式研究方法;;（一）蛋白质组研究中的样品制备 ;样品预分级的主要依据;组织水平蛋白质组样品制备;激光捕获显微切割(laser capture microdissection，LCM) ; LCM纯化肺腺癌细胞;（二）蛋白质组研究中的样品分离;工作原理： 根据蛋白质等电点的不同进行第一向等电聚焦电泳分离 转移到二向SDS-聚丙烯酰胺凝胶上，再根据相对分子量大小不同进行分离; 双向电泳方法的主要步骤： 1. 样品准备 　2. 第一向：固相pH梯度等电聚焦 　3. 第二向：SDS电泳 　4. 染色： 考马氏亮兰或银染 　5. 图像分析：肉眼或自动扫描 ;等电聚焦电泳进行过程中;固相pH梯度等电聚焦的优点;双向凝胶垂直电泳 双向电泳后的凝胶经染色后蛋白呈现二维分布图： 水平方向反映出蛋白在pI上的差异， 垂直方向反映出它们在分子量上的差别。;Isoelectric Focusing (IEF) with IPG strips;IEF;Gel staining;Dysfunctions, Cancer;Differential Expression ;Data evaluation;Differential Analysis;2D Gel Databases;2-DE技术的优点;2-DE技术的缺点 ;（三）蛋白质组研究的样品鉴定; 1. 分子量测定 2. 肽谱测定 3. 肽序列测定 4. 巯基和二硫键定位 5. 蛋白质翻译后修饰 ;Spot identification;样品导入系统 ;Mass Spectrometry;典型二级质谱图;基质辅助激光解吸/电离飞行时间质谱（matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry，MALDI-TOF MS） 电喷雾质谱（electrospray ionization mass spectrometry， ESI-MS） 串联质谱（MS-MS）;（四）蛋白质组学研究的生物信息学;蛋白质组学数据库： ;练习三 熟悉蛋白质分析数据库;蛋白质性质预测;1. Compute pI/Mw;Compute pI/Mw is a tool which allows the computation o