Power and sample size calculations for genetic case-control studies using gene-centric SNP maps资料.pdfVIP

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2018-05-19 发布于湖北
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Power and sample size calculations for genetic case-control studies using gene-centric SNP maps资料.pdf

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Power and sample size calculations for genetic case-control studies using gene-centric SNP maps资料

Original Paper Hum Hered 2005;60:43–60 Received: November 29, 2004 DOI: 10.1159/000087918 Accepted after revision: July 12, 2005 Published online: September 2, 2005 Power and Sample Size Calculations for Genetic Case/Control Studies Using Gene-Centric SNP Maps: Application to Human Chromosomes 6, 21, and 22 in Three Populations Francisco M. De La Vegaa, 1 Derek Gordonb, 1 Xiaoping Sua, 2 Charles Scafea Hadar Isaaca Dennis A. Gilberta Eugene G. Spiera a Applied Biosystems, Foster City, Calif., and b Laboratory of Statistical Genetics, Rockefeller University, New York, N.Y., USA Key Words regression analysis using these factors, average marker- SNP Linkage disequilibrium Association studies marker disequilibrium, and the haplotype diversity Statistical power Sample size Case/control Study across the gene region to determine which factors most design signiﬁ cantly affect average power for a gene in our data. Also, as a ‘proof of principle’ calculation, we perform power and sample size calculations for all genes within Abstract 100 kb of the PSORS1 locus (chromosome 6) for a previ- Power and sample size calculations are critical parts of ou