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铜绿假单胞菌oxa型超广谱β-内酰胺酶耐药基因研究-临床检验诊断学专业论文
硕士学位论文中文摘要摘要目的OXA型超广谱p.内酰胺酶(ESBLs)是由OXA.10,OXA一2和OXA.1三个基因来源的,共分为五组,以第一、二组为主,其主要存在于铜绿假单胞菌中。为了解湘雅医院铜绿假单胞菌中OXA型ESBLs的检出率及其基因的分布情况,开展本次研究。方法收集中南大学湘雅医院2006年9月至2007年1月的非重复铜绿假单胞菌97株,保存于脱脂牛奶管中,放置于.20。C冰箱。所有菌株采用法国梅里埃公司的全自动微生物鉴定系统VITEK.2的GN卡鉴定和ASTGN.13卡进行药敏分析。对97株非重复铜绿假单胞菌采用聚合酶链反应(PCR)进行OXA型ESBLs第一、二组基因筛查,然后用特异性引物对筛查阳性的菌株进行OXA基因扩增,将PCR扩增的DNA产物纯化后进行测序分析,并用BLAST将测序结果与基因库己知序列进行对比分析,确定其基因型。结果经PCR法筛查共检出3株OXA型ESBLs阳性的铜绿假单胞菌,OXA型ESBLs检出率为3.1%(3/97),1株(PAl3)来自尿标本,1株(PAl5)来自痰标本,1株(PAl7)来自引流液标本。这3株PCR扩增阳性的铜绿假单胞菌全部携带OXA型ESBLs第一组基因,OXA型ESBLs第二组未检测到阳性菌株。然后用OXA.10及其衍生物的特异性引物进一步扩增及测序,结果显示,PAl5和PAl7的基因序列完全一致,另1株PAl3为另一不同的基因序列,经GenBank网上同源性比较,均未发现完全相同的核苷酸和氨基酸序列,提示这两种基因序列为新的OXA型ESBLs基因型,命名为blaOXA.128和硕士学位论文中文摘要blaOXA.129,在GenBank上成功注册,基因登录号为:EU573214和EU573215。结论(1)本研究在国际上首次发现两种新型的OXA型ESBLs分别为blaOXA.128和blaOXA.129。(2)在湖南地区首次从铜绿假单胞菌中检出OXA型ESBLs,湘雅医院OXA型ESBLs的检出率较低。关键词:铜绿假单胞菌,超广谱p.内酰胺酶,OXA,聚合酶链反应,基因ABSTRACTObjectiveTheOXA—typeextended-spectrumB—lactamases(ESBLs)areoriginated fromOXA-10,OXA一2andOXA-1.Theyaredividedintofivegroups,GroupI andGroupIIarethemajorgroups.MostofthemareproducedbyPseudomonasaerugenosa.WehavestudiedtheresearchinordertoacquiretheprevalenceandgenotypedistributionofOXA.typeESBLsinPseudomonasaerugenosastrainswhichwereisolatedfromXiangyaHospitalofCentralSouthUniversity.Methods97non·repetitiveclinicalisolatesofPseudomonasaerugenosastrainswerecollectedfromXiangyaHospitalofCentral SouthUniversityfromSeptember2006toJanuary2007,theywereprese—rvedin一20。Crefrigeratorbydefattingmilk.AllofclinicalisolateswereidentificatedandantibacterialsusceptibilitytestedbyBiomerieusautomatedmicrobiological—assaysystemVITEK-2,usingGNidentificationcardsandASTGN一13cards,respectively.Thegenotypesof97PseudomonasaerugenosastrainswerescreenedaboutOXAgroupIandgroupIIbyPCR,thenthegeneofOXAenzymeinpositivestrainswasamplifiedbyspecificprimersandthePCRproductswerepurificatedandsequencedbyautomaticsequencer.Thesequencesacquired werecomparedwiththeknownsequenceinGenBankdatebaseinordertodeterminethegenesubtypebyBLAST
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