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复旦大学基础医学院20152016学年暑期课程-复旦大学精品课程
复旦大学基础医学院 2015~2016 学年暑期课程试卷 √A 卷 □B 卷 课程名称:共生微生物 课程代码:MED130283.01 开课院系:病原生物学系 考试形式:开 卷 姓名: 李涵玉 学号:14301050229 专业:临床医学八年制 题号 一 二 三 总分 得分 一、 什么是元基因组学(metagenomics )?它医学研究领域有什么重要意义? (25 分) 1. 什么是元基因组学? 元基因组(metagenome )是指生态环境中全部 (包括可培养的和不 1 可培养)微生物 (包括细菌、真菌、病毒)基因的总和 。元基因组学 (metagenomics )是一种以元基因组为研究对象,以功能基因筛选和测序 分析为研究手段,以微生物多样性、种群结构、进化关系、功能活性、 2 相互协作关系及与环境之间的关系为研究目的的新的微生物研究方法 。 元基因组学的研究过程为:样品基因组的富集和提取(sample prep ) 3 →测序(sequencing )→分析(analysis )。其中分析包括序列装配(sequence assembly )、微生物群体的分类组成分析(taxonomic composition of the community )、多样性分析、功能分析等。 4 支持元基因组学研究的技术有高通量测序和生物信息学工具等 ,元 基因组学可以进行不依赖微生物培养(culture-independent )的研究。 2. 元基因组学在医学研究中的重要意义。 位于人皮肤、消化道、呼吸道、泌尿生殖道等处的正常微生物群和 致病微生物对人体健康有重要的影响。研究人体、正常微生物群、致病 微生物之间的相互关系可以为医学带来启示。元基因组学突破了大量微 生物无法通过纯培养方法而进行研究的束缚,可以提供微生态的组成、 功能、相互作用等方面的全面的信息,在医学研究中具有重要作用,归 1 李凤, 李艳萍, 张小蒙. 宏基因组学的研究方法进展及应用概述[J]. 生物技术世界, 2015(4):9-10. 2 杨春, 邓绍平. 元基因组研究进展[J]. 实用医院临床杂志, 2015(6):151-153. 3 MulcahyoGrady H, Workentine M L. The Challenge and Potential of Metagenomics in the Clinic[J]. Frontiers in Immunology, 2016, 7(Suppl 2):91-2. 4 Kumar S, Krishnani K K, Bhushan B, et al. Metagenomics: Retrospect and Prospects in High Throughput Age[J]. Biotechnology Research International, 2015, 2015(3). 纳为以下几点: 1) 元基因组学在药物的研发方面有重要意义。通过从生态环境中获
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