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[生物学]microRNA Profiling presentation for 2006 Road show
Welcome To Welcome To 使用MPSS技术 使用MPSS技术 进行microRNA Profiling的介绍 进行microRNA Profiling的介绍 宝生物工程(大连)有限公司 报告内容 MPSS技术简单介绍 使用MPSS进行microRNA的解析方法 miRNA研究工具的介绍 MPSS : Massively Parallel Signature Sequencing Massively Parallel Signature Sequencing 最强有力的基因表达定量解析方法之一。 可以一次获得~ 100万个序列信息 解析的序列长度为20nt左右 通过获得的序列可以确定基因的种类 通过获得序列出现的频率可以得到该基因的表达量 MPSS实施过程 制备Micro-beads Library cDNA Library Micro-beads Library 读取数据 Gen III Instrument A A T G T C C G 读取数据 C G A T C G A T C 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 数据解析 17nt ~ 20nt 1M sequences 被克隆的所有DNA片段序列信 息都可用MPSS方法获知 non-coding RNA AAAAAA AAAAAA GATC CAP AAAAAA 5’-prime 3’-related 使用MPSS进行microRNA的解析方法 microRNA (miRNA) ・19 - 25 nt ( 21-23 nt, 18-24 nt, 20-22 nt, 20-25 nt ) ssRNA ・基因表达的调控 参与细胞的发生、分化、增殖、凋亡、压力应答等的调节 ・与Target mRNA的3’UTR结合进行表达抑制 分解target mRNA使基因转录后沉默 ・有Hairpin构造的前体 lin-4 : C. elegans let-7 : C. elegans miRNA的 形成过程 转录产物 pri-miRNA Drosha pre-miRNA
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