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[农学]09核酸的生物学功能-3
第15章 蛋白质的生物合成-翻译 (一)参与蛋白质生物合成的物质 (二)蛋白质生物合成的过程 (一)参与蛋白质生物合成的物质 1.翻译的模板 2.肽链合成的场所 3.tRNA和氨基酰-tRNA 1.翻译的模板 遗传密码 mRNA中的 3 个碱基编码 1 个氨基酸,此三联碱基组称为一个密码子(codon)。 翻译的方向 沿 mRNA 的 5’→3’方向进行。 遗传密码的主要特征(1)密码子无标点符号;(2)密码子的通用性;(3)密码子的简并性(degeneracy,一个 Aa 具有几个密码子的现象,这几个编码同一Aa 的密码子称为同义密码子,synonymous codon );(4)密码子使用频率不同;(5)密码子与反密码子配对的不严格性。 2.肽链合成的场所 核糖体(ribosome)是蛋白质合成的主要场所。核糖体中催化肽键合成的是rRNA,蛋白质只是维持rRNA构象,起辅助作用。 它能按适当的位置和方向把 mRNA 分子和带有氨基酸的tRNA分子结合在一起,最终将 mRNA 分子的碱基顺序翻译成氨基酸顺序。 (1)核糖体的化学组成 ① 原核生物核糖体的化学组成 ② 真核生物核糖体的化学组成 ① 原核生物核糖体的化学组成 ② 真核生物核糖体的化学组成 (2)核糖体的结构与功能 核糖体的结构至少要满足如下部位: ① 容纳mRNA的部位 ② 结合氨酰基-tRNA的部位(称A位点,aminoacyl site,A site) ③ 结合肽酰基-tRNA的部位(称P位点,peptidyl site,P site) ④ 形成肽键的部位(转肽酶中心) 蛋白质合成过程中一个mRNA的分子上不止结合一个核糖体而是一群核糖体,同时翻译一个 mRNA分子,这些核糖体称为多核糖体(polysome)。 这显著提高了 mRNA的利用率。 一条mRNA的最大利用率可达每 80 个核苷酸结合一个核糖体。 3.tRNA和氨基酰-tRNA 解码系统 (1)氨基酸与tRNA分子的连接 tRNA结合氨基酸的过程称为氨基酸的活化。当氨基酸结合于tRNA以后,就称为氨基酰-tRNA。 mRNA上密码子的每个碱基与tRNA反密码环上的密码子碱基互补形成碱基对。 1965 年 F.Crick 提出摆动假说(wobble hypothesis)。这个假说认为,密码子-反密码子相互作用,要求前两个碱基对是标准型的碱基互补,以保证结合有最大限度的稳定性,第三个碱基则要求不那么严格,可以允许结构上有小小的波动(即摆动), 并允许有某些特异的碱基参与。 Ala 的反密码子TGC,可以识别丙氨酸的同义密码子GCU、GCC、GCA。 (二)蛋白质生物合成的过程 1.翻译的起始 2.肽链的延伸 3.肽链的终止 4.肽链的折叠、加工与转运 1.翻译的起始—原核生物 大肠杆菌蛋白质合成的第一个氨基酸都是甲酰化的甲硫氨酸,即 N-甲酰甲硫氨酸(fMet)。 fMet - tRNAfMet 能特异地识别起始密码子AUG。 (2)翻译起始信号的辨认 mRNA上的起始密码子AUG通常离mRNA5’-末端约20~30个碱基,在这段前导顺序中,具有一段特殊顺序AGGAGGU,位于起始密码子AUG之前的固定位置上,称为S.D序列(Shine-Dalgano顺序)。 核糖体小亚基30s内的16s rRNA 3’-末端有顺序5’-PyACCUCCUUA-3’,Py可以是任何嘧啶核苷酸。 于是核糖体小亚基16s rRNA这段顺序即与 mRNA 前导顺序中的 S.D 序列能够形成稳定的碱基配对。 首先在核糖体小亚基16s rRNA辨认mRNA的S.D序列后,核糖体30S亚基、fMet-tRNAfMet与mRNA结合,形成 30S 起始复合物,fMet-tRNAfMet 结合在mRNA的AUG上。 生成此复合物时需要GTP和3种蛋白起始因子(initiation factor ,IF):IF-1、IF-2 和 IF- 3。这3种起始
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